On

Содержание

Чем заменить праймер для лица * Что использовать вместо праймера

Считается, что при создании стойкого, безупречного макияжа не обойтись без праймера. Специальное средство также помогает выровнять тон и ухаживает за кожей. О его достоинствах не понаслышке знают многие женщины. Однако иногда возникают ситуации, когда необходимо срочно решить вопрос, чем заменить праймер для лица при его недоступности.

Что такое праймер для лица?

Праймер представляет собой основу под макияж. Его функции многообразны.

  • Выравнивает рельеф, маскирует незначительные дефекты.
  • Обеспечивает сохранение макияжа продолжительный период.
  • Создаёт равномерный тон лица.
  • Матирует поверхность, в случае интенсивной работы сальных желёз.
  • Предупреждает проникновение загрязнений вглубь эпидермиса.
  • Ухаживает и увлажняет кожный покров.
  • Защищает от солнечных лучей ультрафиолетовой части спектра.
  • Усиливает яркость декоративной косметики, и придаёт сияние.
  • Упрощает выполнение контуринга.

Выбор средства проводится в соответствии с типом кожи. Неподходящий состав плохо справится с задачей, и параллельно создаст дополнительные проблемы.

  • При жирной коже рекомендуется приобрести праймер, который скроет излишне расширенные поры, предупредит появление жирного блеска. Для этих целей подойдёт минеральный или силиконовый вариант. Первый позаботится о снятии раздражения, скроет покраснения. Второй тип допускается применять только при отсутствии видимых дефектов.
  • Сухую дерму отличает повышенная чувствительность, стянутость, шелушение. В этой ситуации лучше выбрать средство кремовой или жидкой консистенции. Органические кислоты (гликолевая, салициловая) позаботятся об увлажнении и бережном очищении.
  • Для комбинированной кожи применяют минеральный и силиконовый состав. На зоны повышенной жирности наносят первое средство, остальную часть обрабатывают праймером на основе силикона.
  • Зрелая кожа нуждается в заполнении морщин, что позволяет сделать их практически незаметными. Обеспечить подобный эффект под силу силиконовому средству. В состав также входят увлажняющие компоненты и антиоксиданты. Табу накладывается на светоотражающие частицы.

В зависимости от решаемых проблем праймер обладает особым оттенком.

  • Для области глаз подходит состав розового или жёлтого цвета. Первый уберёт серость, а второй синяки.
  • Хорошо маскирует возрастные изменения фиолетовое средство, возвращающее молодой вид.
  • Добиться фарфоровой прозрачности кожи можно с помощью белого и голубого продукта.
  • Дерма с большим числом покраснений, воспалений и других дефектов станет выглядеть безупречно с зелёным праймером.

Если говорить о текстуре базы под макияж, то выделяют несколько видов.

  1. Бесцветная масса на силиконовой основе в форме геля предназначена для выравнивания рельефа. Её применяют для жирной и зрелой кожи при условии отсутствия других проблем.
  2. Кремовая консистенция подходит любому типу дермы. Она легко наносится и дарит увлажнение.
  3. Жидкий состав на водной основе (лосьон) практически не ощущается на коже. Очень быстро насыщает слои эпидермиса влагой, что способствует улучшению состояния по цвету и рельефу.
  4. Масляная субстанция не подходит для обладательниц жирного и комбинированного типа кожи. Если же дерма сухая или нормальна, то с помощью праймера она получит питание, повысит упругость, станет более ровной. Ещё один плюс — тональный крем чрезвычайно легко распределяется по такой основе.

В данном виде подробно описано о видах праймеров под макияж:

Чем можно заменить праймер для лица?

Некоторые функции праймера могут выполнить другие средства. Их использование вполне оправдано. Итак, чем можно заменить праймер для лица? В качестве альтернативного варианта предлагается:

  • дневной крем с увлажняющим эффектом;
  • BB-крем;
  • бальзам после бритья;
  • пудра.

Некоторые приспособились заменять праймер шариковым дезодорантом или аптечным препаратом от раздражений. Первое средство хорошо справляется с жирным блеском, обеспечивая матовость кожи. Второй вариант быстро впитывается, имеет лёгкую текстуру, не содержит аллергенов, а также помогает подсушить воспаления и справиться с раздражением.

Увлажняющий крем

Дневной рем для лица с увлажняющим действием иногда можно использовать вместо праймера. Состав призван заботиться о дерме, наполнять её влагой. После нанесения поверхность приобретает мягкость и выравнивается, так что вполне может стать базой под макияж. Это наиболее оптимальный вариант замены праймера в домашних условиях, так как в арсенале каждой женщины наверняка присутствует увлажняющий крем для лица.

BB-крем

Это средство уже обладает лёгким тонирующим эффектом, поэтому если его использовать вместо праймера для лица, стоит ограничиться небольшим количеством. Кроме того состав способствует увлажнению, питанию, созданию однородного оттенка.

Бальзам после бритья

В экстренной ситуации праймер для лица с успехом заменяет бальзам после бритья. Он отвечает за матовость, снимает раздражение, делает поверхность кожи более мягкой и ровной.

Пудра

Пудра обычно необходима для финального аккорда при создании макияжа. Однако благодаря тому, что в её составе отсутствуют жиры, при нормальной, комбинированной и жирной коже пудра может использоваться в качестве базы под макияж. Важный момент: если присутствует шелушение, то средство категорически не подходит.

Пудра из зелёного чая станет отличным решением для угреватой кожи.

При усиленном образовании сального секрета стоит попробовать состав, содержащий рисовую пудру, кукурузный крахмал или глину. Устранение жирного блеска полностью гарантировано.

Дамам в возрасте рекомендуется пудра с шёлком.

Существует также возможность приготовить базовую основу под макияж для жирной кожи самостоятельно. В состав входят простые и доступные ингредиенты.

  • Детский крем в объёме 1 ч. л.
  • По четверти чайной ложки цинковой мази, кукурузного крахмала и рисовой муки.

Домашний рецепт обеспечивает снижение жирности, противовоспалительный эффект, препятствует расползанию и скатыванию декоративных средств.

ТОП-5 бюджетных праймеров для лица

Особой популярностью у женщин пользуются средства, обладающие доступной ценой, но вместе с тем, обеспечивающие достойный результат.

В пятёрку недорогих праймеров входит продукция разных фирм.

  • Состав от Lumene ровно ложится, увлажняет, заполняет неглубокие морщины, придаёт коже лёгкое сияние. Тональный крем прекрасно контактирует с базой, прочно удерживается на лице в течение всего дня.
  • Тем, кто стремиться отстрочить увядание стоит обратить внимание на основу Make Up Base With Anti-Aging Effect марки Artdeco. Она способна справиться с мелкими дефектами, благодаря специальным добавкам замедляет процесс старения. Этот праймер рекомендован к применению начиная с 25 лет.
  • Продукт от VOV представлен в пяти оттенках, которые позволяют маскировать дефекты разной природы. Например: участки воспаления, красноту, неравномерный тон, выраженную сосудистую сетку и др. Основа под макияж Pure Make-up Base также способна придать лицу нежное сияние.
  • Присутствие частиц, обладающих эффектом отражать свет, делает белую основу Illuminating Primer Make Up Base (Flormar) прозрачной, а лицо сияющим. Благодаря гелеобразной консистенции средство легко наносится и равномерно распределяется. Тональный состав ложится ровно и надолго сохраняет первоначальный вид. Натуральные экстракты зелёного чая и белой акации отвечают за питание и увлажнение.
  • Знаменитый производитель косметики фирма Maybelline New York предлагает свой вариант недорогой основы под макияж — Baby Skin. Её свойства следуют из названия. После нанесения кожа приобретает гладкость, как у ребёнка. Состав хорошо скрывает мелкие морщины, заполняя их, обеспечивает матирующий эффект. Тональное средство не скатывается, позволяя сохранить идеальный вид в течение долгого времени.

Вывод

Праймер готовит кожу к нанесению декоративной косметики. Благодаря ему макияж сохраняется намного дольше. Состав следует выбирать в зависимости от типа и состояния кожи, ожидаемого эффекта.  Иногда, к сожалению, придётся испробовать несколько средств, чтобы найти идеальный вариант.

Невероятно! Узнайте, кто самая красивая женщина планеты 2020 года!

25 красивых женщин планеты

Чем заменить праймер для ногтей при наращивании гелем, аналог

Чем можно заменить праймер для ногтейОписание
Столовым уксусомЕсли протереть ногтевую пластину ватным диском, предварительно смоченным в столовом уксусе, можно быстро обезжирить ее, что и требуется перед наращиванием ногтей или покрытием их гель-лаком.

Мастера ногтевого сервиса, да и сами девушки, которые делают маникюр дома, замечают, что после уксуса ногтевая пластина быстро просыхает и первый нанесенный базовый слой хорошо высыхает в лампе.

Есть мнение, что использование уксуса вместо праймера продлевает срок носки покрытия, но мастера опровергают такую версию. Единственное, что они могут точно утверждать, что уксус не способен повредить ногтевую пластину.

СпиртомИспользование спирта перед покрытием цветовым пигментом, гелевым, акриловым наращиванием вполне оправдано.

Спирт хорошо обезжиривает, быстро сушит. В итоге покрытие ляжет ровным слоем, не будет отходить.

Жидкостью для снятия лакаЧтобы быстро обезжирить ногтевую пластину, подготовить ее к будущему наращиванию, покрытию с использованием цветового пигмента стоит использовать средства для снятия лака с ацетоном.

Еще одно преимущество такой жидкости – в ее способности немного приподнимать чешуйки, расположенные на верхнем слое ногтевой пластины. Благодаря этому в дальнейшем обеспечивается лучшая сцепка с покрытием, гелем, акрилом.

Важно, чтобы в выбранном средстве отсутствовали масляные компоненты.

Они создадут на поверхности ногтя жирную пленку, из-за которой покрытие будет носиться гораздо хуже, наращенные ногти могут начать быстро отходить.

Праймер для ногтей используется для обезжиривания поверхности, обеспечивая более качественный маникюр. Благодаря этому в дальнейшем происходит длительная сцепка с наносимым красящим пигментом – гель-лаком или материалами для наращивания ногтей (гелем, акрилом).

Мало кому известно, но праймер – это еще и антибактериальное средство. Он защищает ногтевую пластину от развития патогенных микроорганизмов под нанесенным покрытием.

Разновидности праймеров для ногтей

Прежде чем начинать искать, чем можно заменить праймер для ногтей, следует внимательно изучить его состав.

Все продукты этой категории разделены на два вида:

  • кислотные;
  • бескислотные.

Кислотный праймер

Метакриловая кислота содержится в кислотном праймере в количестве от 30 до 100%.  Этот компонент обеспечивает прочную сцепку ногтя и применяемого лака или другого материала. Наращивание ногтей с применением акрила акрил, не обходится без использования праймера – это идеальный вариант, обеспечивающий качественное покрытие.

Важно знать, что такой праймер сушит пластину. Использовать его нужно обладательницам жирных ногтей. В процессе нанесения средство не должно попадать на кожу.

Его компоненты приводят к жжению. У некоторых начинает краснеть кожа. После высыхания нанесенного продукта на ногте остается легкий налет белого цвета – его появление свидетельствует, что можно выполнять саму процедуру наращивания.

Бескилотный праймер

Безопасным вариантом для кожи вокруг ногтя и самой пластины считается бескислотный праймер. У него есть недостаток – в отличие от кислотного состава этот продукт не обеспечивает такую надежную сцепку с акрилом при наращивании.

При этом он сохраняет антибактериальные свойства, поэтому можно не волноваться, что под наращенными ногтями развиваются патогенные микроорганизмы.

Такой вид продукта используется для покрытия гель лаком.

Праймер для наращивания ногтей гелем

Для наращивания ногтей гелем специалисты нейл-индустрии рекомендуют использовать бескислотный праймер. Наносить его нужно в 2 слоя.

Если при наращивании используются типсы, праймер не должен на них попадать, иначе могут появиться трещины. Во время коррекции мастер наносит этот продукт исключительно на отросшую часть ногтя, но не на искусственное покрытие.

Чем можно заменить праймер для ногтей

Специалисты говорят о том, что по возможности не стоит искать альтернативные варианты праймеру для ногтей. Есть ряд продуктов, которые обладают похожими свойствами, но они не смогут полностью заменить все необходимые характеристики.

В крайнем случае, разрешено использовать:

  • столовый уксус;
  • спирт;
  • жидкость для снятия лака.

Есть несколько вариантов, чем можно заменить праймер для ногтей. У каждого из них есть ряд достоинств, но присутствуют и недостатки, которые могут негативно отразиться на ногтевых пластинах. Чтобы результат проделанной работы не разочаровал, учитывайте все нюансы перед выбором альтернативного варианта.

Автор: Редакция сайта

что использовать, как применять, советы и рекомендации специалистов — RUXA

Содержание статьи:

Залог качественного и долгосрочного маникюра — грамотная предварительная обработка ногтевой пластины. Как правило, одного лишь лака-базы недостаточно, этот слой также может оказаться неустойчивым, если находящийся под ним ноготь не будет подготовлен. А делается это с помощью так называемого праймера. О его функциях знают все, точно так же, как и о необходимости его применения. Но чем можно заменить праймер, если его нет под рукой, а маникюр следует обязательно закончить? Рассмотрим этот вопрос!

Краткое вступление

Прежде всего, стоит понять, что представляет собой праймер и под каким названиями можно еще встретить данное средство. Итак, в буквальном переводе слово «праймер» означает «грунтовка».

Очевидно, что данный продукт призван подготовить ноготь к нанесению дальнейшего декоративного слоя или нескольких слоев. При этом он обязан выполнять определенные функции, а именно:

  • Вытягивать излишнюю влагу из ногтя.
  • Снимать с поверхности жирный слой.
  • Делать поверхность немного шероховатой.

Вам будет интересно:Отбеливающие кремы для тела и лица

Все это необходимо для того, чтобы базовый слой гель-лака или наращиваемого состава наиболее плотным образом «приклеился» к ногтевой пластине. Но бывает, что это чудо-средство в самый неподходящий момент заканчивается, и тогда возникает вопрос: чем можно заменить праймер, сохранив данный функционал?

№1 — ацетон

Первое, чем можно заменить праймер для ногтей — это средство для снятия лака с содержанием ацетона. Именно такое, агрессивное и «вышедшее из моды», а не те изысканные пузырьки, которые ныне в ассортименте продаются в качестве щадящих. Все просто — в средстве «Ноготок» много ацетона, и именно этот компонент позволяет одновременно вытянуть ненужную влагу из ногтя, обезжирить его и создать легкую шероховатость на поверхности.

Важно помнить, что если вы покупаете не «Ноготок», а иной аналогичный продукт, изучите его состав. В нем не должно быть масел, так как именно от них мы избавляемся с помощью праймера, ведь именно они мешают маникюру долго держаться на ноготках.

№2 — уксус

Средство, которое содержит в себе большое количество кислот, необходимых для качественного обезжиривания ногтя. Это то, чем можно заменить праймер в домашних условиях, когда даже ацетона нет под рукой. Средство действует более щадяще, нежели его фирменный аналог, но при этом параллельно оказывает положительный эффект на ногти и кожу вокруг них. Кутикула размягчается, пальчики становятся более нежными, кожа очищается. Важно отметить, что с помощью белого столового уксуса, увы, невозможно приподнять чешуйки ногтя так, чтобы лак с поверхностью максимально прочно сцепился. Но компенсировать этот недостаток можно с помощью пилки. Мастера советуют выбрать среднюю абразивность и обработать ею каждый ноготок.

Вам будет интересно:»Елисейские поля Герлен»: отзывы, описание аромата, главные ноты

№3 — этиловый спирт

Данный препарат действует по аналогии с уксусом, однако отличается от своего предшественника отсутствием кислот в составе. Важно также отметить, что отсутствие кислот вовсе не означает, что продукт более бережно будет относиться к ногтям. Наоборот — спирт может сильно иссушить и сам ноготь, и кожу вокруг него, что в дальнейшем вызовет массу дискомфорта. Поэтому использовать его нужно крайне осторожно, наносить на ноготки, не касаясь кутикулы, и только один раз. При этом, как и белый столовый уксус, этиловый спирт не сможет обеспечить достойного сцепления лака и ногтя. Именно поэтому нужно снова взять пилку и обработать поверхности ногтей, чтобы те стали более шероховатыми и закрепили на себе все дальнейшие слои маникюра. Кстати, если вы ищите то, чем можно заменить праймер для наращивания, то спирт будет лучшим кандидатом. Он сильнее всех иссушит ноготь, что позволит гелиевой или акриловой смеси закрепиться на нем на весьма длительный срок.

№4 — спиртосодержащие жидкости

Часто бывает, что чистого спирта в доме нет — ничего удивительного, в последние годы он не считается «маст-хэвом» в аптечке, так как имеет множество более «гуманных» альтернатив. Вот их и можно взять в обиход. Как правило, то, чем можно заменить праймер, найдется в любой аптечке. Это настойки на различных травах и ягодах, спиртовые растирки для суставов и мышц, некоторые гомеопатические препараты от простуды на основе этила и т. д. Они будут неплохо справляться с жирным слоем ногтевой пластины, и, в зависимости от «агрессивности» воздействия, смогут приподнять чешуйки ногтя и сделать его более пористым. В качестве бонуса специалисты отмечают, что многие подобные средства также оказывают положительное влияние на структуру самого ногтя и состояние кутикулы. Пальцы преображаются и дольше сохраняют ухоженный внешний вид.

№5 — борная кислота

Вот мы снова вернулись к кислотам, которые также отлично справляются с функцией обезжиривания и подготовки ногтевой пластины к дальнейшему нанесению декоративных слоев. Борная кислота является средством универсальным, имеется практически в каждом доме и даже в каждом офисе, поэтому быстро применить ее в маникюре будет весьма просто. Обратите внимание на то, что если процент у кислоты весьма высокий, ее желательно разбавить с водой, в противном случае можно сильно пересушить кутикулу и сам ноготь. Также «плюсик» этому средству добавляет тот факт, что оно входит в состав многих ультрабондов — то есть праймеров для ногтей.

Вам будет интересно:Эфирные масла для мужчин: свойства масел и их правильное применение

№6 — салициловая кислота

Ну а тут мы видим, как средство, которое отлично справляется с различного рода кожными дефектами, помогает временно решить проблему отсутствия ультрабонда для ногтей. Когда вы дома не знаете, чем можно заменить праймер из-за отсутствия всех вышеперечисленных средств, воспользуйтесь этим. Салициловая кислота поможет вам добиться практически идеального результата. Она подсушивает качественно, но при этом бережно, отлично дезинфицирует, убирает лишнюю влагу с поверхности ногтевой пластины. При этом если ее концентрация не слишком велика, ноготь станет немного шершавым, ее верхние слои приподнимутся. Вам останется лишь окончательно «задрать их вверх», пройдясь по ним пилочкой. После этого можете смело наносить покрытие и быть уверенной в том, что продержится оно добротно.

№7 — водка

Мы уже обсудили все аптечные средства, в основе которых лежит спирт, но забыли про этот не слишком полезный напиток. В данном случае это отличная альтернатива, чем заменить праймер для гель-лака, и потратить данную жидкость с большей пользой. Весьма удобно приобрести на кассе мини-бутылочку, если в доме нет никаких иных средств для обезжиривания ногтевой пластины, а до ближайшей аптеки идти весьма долго. Отметим, что водка не столь агрессивна, как чистый спирт, поэтому ею можно пользоваться без излишних опасений, и порою требуется обработать ногти дважды или трижды, чтобы добиться желаемого эффекта.

№8 — одеколон

Завершает наш перечень тех продуктов, чем можно заменить праймер для гель-лака, именно это ароматическое средство. Оно содержит в себе более 70 процентов этилового спирта, поэтому появление в данном рейтинге вполне обосновано. Большей «агрессивностью» относительно чешуек ногтей обладают именно мужские одеколоны. Но вы также можете использовать женскую парфюмированную или туалетную воду, только повторите процедуру несколько раз. Также плюсом данного метода считается то, что некоторые эфирные масла, которые входят в состав ароматов, оказывают также высушивающее действие. Это чайное дерево, цитрусы, белые цветы и т. д. Поэтому, чем свежее ваш парфюм — тем лучше! Ну и в качестве бонуса вы получаете аромат, который в буквальном смысле слова будет спрятан под ваш маникюр.

Советы мастеров

Эксперты в области маникюра ответили положительно на вопрос о том, можно ли заменить праймер бытовыми или аптечными средствами. Далее они дают рекомендации относительно применения одного из выбранных продуктов.

  • Не стоит использовать ватные диски и тем более саму вату для обезжиривания ногтя — в чешуйки забьются мелкие ворсинки и они испортят маникюр. Подойдет безворсовые салфетки, изделия из льна, бязи или иного натурального материала.
  • С самого утра в тот день, когда собираетесь делать маникюр, не пользуйтесь кремами и маслами, а почаще мойте руки. Жиры от данных средств очень глубоко проникнут в структуру ногтя и их будет вымыть очень сложно даже первоклассным праймерам.
  • Не забывайте про обработку ногтевой пластины пилкой — можно до нанесения заменителя праймера, можно после.
  • Не прикасайтесь к ногтям, которые вы только что обезжирили — все усилия окажутся напрасными.

Заключение

Получается, что сделать маникюр можно по более бюджетной схеме, не приобретая дорогостоящих ультрабондов. Для домашнего варианта, когда вы работаете над своими ногтями, или ногтями своих родных и близких, это нормально. Но если работать с клиентами даже дома, то подобная методика вызовет негодование. Заменители будут актуальными для экстренных ситуаций, но на постоянной основе их можно использовать только для себя.

Источник

для чего он нужен, как пользоваться, чем можно заменить

Каждая женщина, которая хоть раз наращивала ногти, видела, как мастер покрывает ногти бесцветной жидкостью с резким запахом, так называемым «праймером». Зачем нужна эта жидкость – рассмотрим в статье.

Ответим на вопрос, можно ли нарастить ногти без этого средства. Также разберемся, какие праймеры лучше использовать и как с ними правильно обращаться.

Что такое праймер

Праймер наносится первым слоем в процедуре наращивания, это специальная база для гелевых ногтей. Он необходим, чтобы убрать с поверхности ногтя загрязнения, обезжирить её. Химический состав праймера обеспечивает сцепление поверхности ногтя и полимерного материала.

Для чего нужен праймер

Схема работы праймера

  • Состав выполняет защитную функцию. Не секрет, что процедура наращивания — не самая щадящая для натуральных ногтей. Часто пластина слабеет, свои ногти под искусственными начинают слоиться. Праймер делает несущественными негативные последствия нанесения акрила или геля на ногтевую пластину.
  • От того, наносит ли мастер маникюра праймер на ногти клиента, зависит, сколько времени проходит женщина со своими красивым длинными ногтями, так как он обеспечивает сцепление геля или акрила с поверхностью ногтя.
  • Праймер необходим для дополнительного обезжиривания поверхности ногтя и удаления с него мельчайших соринок и пыли.

Состав и внешний вид

Праймер — химическое соединение, состоящее из специальным образом подобранных компонентов: ацетона, воды, полимеров, обеспечивающих положительный результат работы вещества, эфирных масел и отдушки.

К составу кислотного праймера добавляется метакриловая кислота. Внешне это бесцветная жидкость со специфическим «химическим» ароматом.

Препарат не густой, по консистенции больше всего похож на воду.

Виды праймера

Профессиональный мастер маникюра имеет в своем арсенале несколько видов праймера на все случаи жизни. Это кислотный состав, бескилотный и преп-праймер. Чем они отличаются, разберемся.

Виды праймераХарактеристика средства
Преп-праймер (бондер)1. Существенная разница с другими видами: он не содержит агрессивных компонентов, действие его щадящее и мягкое. Не нарушает PH-баланс натуральной пластины.
2. Для наращивания не походит, его воздействие не обеспечивает необходимого сцепления геля или акрила с ногтем. Его используют при нанесении обычных лаков или перед праймером, чтобы убрать с поверхности ногтя пот, дополнительно защитить пластину, обезжирить ее.
Кислотный праймер1. В составе препарата присутствует метакриловая кислота.
2. Обеспечивает отличное сцепление, поскольку кислота способна приподнимать роговые чешуйки ногтя, чтобы искусственный материал проник под них, «намертво» сцепившись с натуральным ногтем. Нужен для акрилового наращивания.
3. Средство довольно токсично.
4. Это самый агрессивный из всех видов праймера. Его использование допускается, только если ногти здоровые и крепкие.
Бескислотный праймер1. Не содержит кислоты, поэтому его воздействие мягче и безопаснее.
2. Обладает замечательным качеством сцепления.
3. Подходит тонким, слабым ногтям, не вредит им.
4. Самые продвинутые производители товаров для наращивания, такие как OPI, CND, Irisk и прочие, рекомендуют применять при наращивании исключительно бескислотные версии праймера.

Популярные бренды

Фирмы, которые предлагают наилучшее соотношение качества и цены:

  • RuNail — бюджетная марка качественных товаров для наращивания и маникюра. Цена достаточно низкая, но при этом средство обеспечивает надежное сцепление.
  • CND — одна из старейших марок, стоит у самых истоков наращивания ногтей. Продукция очень качественная, в ней полностью отсутствуют токсичные компоненты, но она в то же время и довольно дорогая.
  • Mozart House – австрийская марка, выпускающая качественную продукцию для ногтей. Цена ниже, чем у CND, но тоже не самая маленькая. Однако качество товара на высоте: их праймер гарантированно обеспечит отличное сцепление.
  • Lady Victory — еще одна бюджетная марка. Многие мастера предпочитают работать именно с ней, говоря о ее хорошем качестве и низкой стоимости.

Чтобы определиться с тем, какой праймер выбрать, послушайте советы профессионала:

Отличия праймера от прочих маникюрных жидкостей: обезжиривателя, дегидратора и бондера

  • Обезжириватель — мягкая жидкость, которая снимает лишний жир и грязь с поверхности ногтя. Он применяется на протяжении всей процедуры наращивания, в то время как праймер — только один раз в самом начале.
  • Дегидратор нужен, чтобы высушить пластину, удалить лишнюю влагу, пот. Чаще всего дегидратор применяют, если руки клиента имеют свойство чрезмерно потеть.
  • Про бондер (бонд) написано выше, это так называемый преп-праймер.

Заменять праймер другими жидкостями для маникюра нельзя: они не обеспечат нужного сцепления ногтя с покрытием.

Как наносить праймер: пошаговая инструкция

Технология нанесения праймера на ногтевую пластину очень проста:

  • После предварительной обработки ногтевой пластины и ее обезжиривания кисточкой, которой снабжен каждый флакончик, нанесите средство на поверхность ногтя. Никакими другими инструментами нанесение праймера не выполняется. Не допускайте попадания средства на боковые валики ногтя.
  • Убедитесь, что средство попало во все уголки ногтевой пластины и ни один участок не остался без обработки. В ином случае впоследствии может произойти отслоение.
  • Средство моментально сохнет, и это будет видно. Высыхает праймер на воздухе — махать руками и сушить в лампе не нужно. После высыхания можно наносить моделирующий материал.

Наносите праймер тонким слоем, иначе гель или акрил ляжет неровно.

Техника безопасности при работе

  • Всегда надевайте перчатки.
  • Держите флакон со средством плотно закрытым. Жидкость летучая, поэтому может элементарно испариться.
  • Во время применения праймера надевайте медицинскую маску или хотя бы тканевую повязку и старайтесь глубоко не вдыхать его запах.
  • Помещение должно хорошо проветриваться или вентилироваться.
  • При аллергии на праймер можно заменить его более мягким вариантом другой марки.

Где купить

Лучше всего покупать средство в магазинах, торгующих профессиональной косметикой для салонов красоты. Именно там вы найдете качественную продукцию с необходимыми сертификатами. При покупке смотрите на срок годности и марку.

Критерии качества праймеров очень индивидуальны, и их можно выяснить только опытным путем. Если ногти будут держаться положенный срок, значит средство подходит и им можно пользоваться.

Не рекомендуется выбирать дешевые китайские праймеры, заказывать их у подозрительных компаний в интернете. Вы имеете серьезные шансы навредить своему здоровью, применяя подобную продукцию при наращивании. Нередки ожоги, полностью испорченная ногтевая пластина и прочие неприятности. Лучше приобретать проверенные средства и не рисковать здоровьем.

Дополнительные советы по выбору праймера вы найдёте в видео ниже:

Чем заменить в домашних условиях

Часто женщина недооценивает важность праймера и считает, что в домашних условиях эту жидкость можно с успехом заменить какой-нибудь другой. Но можно с уверенностью утверждать, что любая другая жидкость, будь это спирт, ацетон или одеколон, способна только обезжирить поверхность, но вот обеспечить сцепление никакое другое средство, кроме праймера, не в состоянии. Поэтому о полноценной замене речи быть не может.

Вместо праймера никакое другое обезжиривающее средство не используется.

Праймер – важнейшее средство в маникюре, обойтись без него при моделировании ногтей невозможно. Отнеситесь ответственно к выбору этого средства. Выбрав качественный праймер, вы уже на 50% гарантируете успешный и качественный результат.

Чем можно заменить праймер для лица?

Можно ли чем-то заменить праймер для век?

Незаменимых бьюти-средств, кажется, нет — изобретательные бьютиголики всегда найдут достойную альтернативу тому, что отсутствует в их косметичке. С праймером для век — та же история. Вместо него можно использовать целый ряд средств. Чем заменить базу под тени?

Плотный и стойкий тональный крем или консилер с теми же свойствами

Распределите средство по веку легкими вбивающими движениями и приступайте к созданию макияжа глаз.

Карандаш

Заштрихуйте им веки. Используйте белый, чтобы цвет теней, нанесенных поверх, стал ярче. Если в этом нет необходимости, выручит и обычный нюдовый оттенок. А кайал с плотной жирной формулой обеспечит лучшее «сцепление» с другими текстурами.

Пудра

Достаточно слегка припудрить веки, чтобы избавиться от жирной пленки и подготовить кожу к макияжу. Правда, если вам нужна предельная стойкость, пудровая база едва ли с этим справится.

Кстати, чтобы увеличить стойкость макияжа глаз, вы можете воспользоваться лайфхаком — попробовать нанести тени влажным способом, предварительно смочив кисть в воде.

Какой праймер для лица выбрать: обзор лучших фирм

Праймер выбирают основываясь на его свойствах и характеристиках, дабы он наилучшим образом подошел в отдельно взятом случае. Хорошо, что выбор такой продукции в косметических магазинах велик и можно подобрать продукт, подходящий и по параметрам, и по ценовой категории. Рассмотрим несколько позиций данного средства от разных производителей.

Силиконовый праймер Code Color

Продукт бесцветный, текстура легкая и не жирная, в нанесении удобен и прост. Сразу после растушевки на лице чувствуется эффект – кожа визуально становится ровнее, на ощупь бархатистой и нежной. Блеск не оставляет, также не дает неприятного эффекта маски на лице.

Clinique Superprimer Face Primer матирующий

Выпускается в 6-ти вариантах цвета, среди которых есть универсальный прозрачный, розовый, желтый, коричневый, персиковый и лавандовый оттенки. Консистенция средней густоты, похожа на смесь крема и геля. На базе макияж держится очень долго, жирные участки не проявляются. В состав также включены компоненты, обладающие успокаивающим и увлажняющим свойством.

Jafra Makeup Primer

Единственный нюанс – не стоит использовать при жирной коже, так как матирующий эффект не ярко выраженный, и блеск может довольно быстро проступить, а вот для сухой кожи подходит просто идеально.

Продукт относительно новый на рынке, найти его можно в сети магазинов Летуаль.

Tony Moly Egg Pore сужающий поры

В состав входят натуральные компоненты, в том числе экстракт календулы, так что средство при использовании дополнительно ухаживает за кожей. При снятии праймера с лица в конце дня можно заметить явный эффект очищения – с ним из пор выходят излишки жира и прочие загрязнения.

Правила пользования праймером

Косметологи советуют ответственно подходить к выбору и нанесению базы под макияж. Твердую основу следует выбирать в случае, когда на лице есть «ямки» или рубцы.

Жидкий вариант рекомендуется тем, у кого нет серьезных проблем, а нужно придать ровный тон и матовость. Для ресниц, губ, кожи вокруг глаз есть специальные составы, разработанные с учетом особенностей конкретных зон.

Пошаговая инструкция

База должна наноситься только на увлажненную кожу, чтобы не было заметно шелушений

Кроме того, следует тщательно очистить поры, уделяя внимание подбородку, лбу, носу и щекам

Как правильно наносить праймер

Специалисты для нанесения праймера советуют использовать специальные спонжи или пористые подушечки.

Поэтапное нанесение праймера:

  • Обработать кожу очищающим лосьоном или же воспользоваться мицеллярной водой.
  • Нанести средство с помощью слегка увлажненного спонжа. Двигаться нужно от глаз по направлению к щекам. Состав следует аккуратно вбивать в кожу, а не растирать его.
  • Растушевать средство по крыльям носа, подбородку и лбу.
  • Точечно следует обработать зоны покраснений зеленым средством. Круги под глазами убираются при помощи розового или желтого тонов.
  • Подождать несколько минут перед нанесением тонального крема, чтобы средство впиталось.

В некоторых случаях праймер может заменить тональную основу, но этот вариант подходит для обладательниц сухой кожи с незаметными порами.

Состав праймера для ногтей

Праймер представляет собой прозрачную жидкость, которая не имеет запаха и по консистенции напоминает обычную воду. Она содержится в пластиковом либо стеклянном флаконе с кистью, аналогичной кисточке любого лака. Флакон чаще всего делается непрозрачным для обеспечения сохранности средства.

По своему составу праймеры отличаются в зависимости от производителя, но их принято делить на два больших класса: кислотные и бескислотные. Ароматизаторы и красители принято исключать из состава средств для обеспечения безопасности людей с повышенной чувствительностью и аллергиков.

Кислотный праймер в своем составе содержит метакриловую кислоту в концентрации от 30 до 100%. Благодаря ей чешуйки верхнего слоя ногтей образую прочную связь с материалом, поэтому такой праймер рекомендуется использовать при наращивании ногтей акрилом. Кислотный праймер сильно высушивает ногтевую пластину, поэтому использовать его лучше для жирный ногтей и ногтей в форме трамплина.

Бескислотный праймер более щадящий и менее опасный для кожи, но и чуть уступает кислотному по эффективности сцепки материала с ногтевой пластиной. Этот вид праймера рекомендуется к использованию при наращивании гелем и покрытии ногтей гель лаком. Он также удаляет жир с ногтей, подсушивает их и удаляет вредные микроорганизмы, образуя надежную связь между чешуйками верхних слоев ногтей и искусственным материалом.

При наращивании ногтей гелем на типсы или формы достаточно использовать любой бескислотный праймер. Однако иногда его нужно нанести 2 раза, чтобы повысить надежность сцепления

Обратите внимание, что при наращивании гелем на типсы стоит избегать попадания праймера на них: это может привести к появлению трещин. Праймер наносится также и при коррекции ногтей, но только на отросшую часть натурального ногтя, не допуская попадания на кожу

При наращивании ногтей с использованием акриловой пудры рекомендуется использовать кислотный праймер как самый надежный по свойству сцепления поверхности ногтя с искусственным материалом. Он не влияет на цвет акрила и надежно защищает его от трещин и появления отслоек, конечно, при условии правильного его использования.

Понятие и предназначение средства

Нужна ли база под макияж?

Перед нанесением декоративной косметики нужно подготовить кожу, выровнять ее и скрыть определенные недочеты.

Именно с этим и справляется база под макияж. Вне зависимости от вида средства оно будет включать в себя силикон и пигмент.

Последний служит для скрытия недостатков, а первый помогает обеспечить стойкость макияжа и выравнивает эпидермис.

Классическая база под макияж решает такие задачи:

подготовка кожи к тональному крему, ее предварительное выравнивание. Это качество основы актуально, если у вас проблемная кожа, есть акне, различные впадинки и бугорки. База поможет придать коже идеальный вид;

смягчение и увлажнение кожи, разглаживание морщин

Особенно это важно, если кожа сухая. С базой нанести на нее макияж будет намного проще, он ляжет равномерно и не будет забиваться в морщинки

Это качество актуально для возрастного макияжа;

устранение тех или иных дефектов. База может скрыть не только неровности, но и прочие неприятности. Это заметные поры, покрасневшие участки, желтизна или серый оттенок кожи, результат чрезмерного загара;

борьба с жирным блеском. Если кожа комбинированная или жирная, требуется матирующая база, в особенности в летний период;
благодаря основе кожа выглядит здоровой, она сияет изнутри. Если вы постоянно устаете или не высыпаетесь, выбирайте средство со светоотражающими частичками. Это добавит здорового свечения;

защита от лучей солнца. Летом будет полезна база с фильтрами, не дающими ультрафиолету негативно влиять на кожу.

Для чего применяется праймер для ресниц

Подготовить поверхность волосков для нанесения туши – вот главная задача этого средства. Природные реснички обычно покрыты жировой пленкой, защищающей их. Однако сама она остается беззащитной и потому наполняется бактериями, пылью и грязью. Чем сильнее потоотделение, тем меньше шансов, что тушь будет держаться. В таких случаях основа просто незаменима. Праймер отлично обезжиривает волоски, позволяя туши равномерно распределяться и держаться долгое время.

Полезные качества компонентов этого средства:

  • Дезинфекция этиловым спиртом.
  • Увлажнение и защита аллантоином, который оказывает полирующий эффект.
  • Праймер не допускает склеивания ресниц, придает им действительно ухоженный, но в то же время естественный вид, создает выразительный взгляд без особых усилий.
  • Стимуляция фолликулов с помощью пептидов, то есть ускоряется рост ресничек, они выглядят здоровыми и пушистыми.
  • Защита от негативного воздействия косметических средств, которую обеспечивает пантенол.
  • Витамины и эфирные масла бережно ухаживают и укрепляют реснички.
  • Кератин воздействует глубоко в порах волосков, делая их менее ломкими и упругими.

Суть воздействия праймера на волосок – создание на его поверхности тонкой пленки, которая позволяет туши красиво и долго лежать на нем, не осыпаться, не опадать при плохой погоде. Также это средство отлично защищает от любых косметических воздействий, что пригодится тем, у кого аллергия на тот или иной вид косметики.

Ошибки в применении

Казалось бы, все просто, но, тем не менее, далеко не все могут использовать базу правильно

Обратите внимание на такие ошибки, и не повторяйте их:

  • базовая основа – это не дневной крем, и наносится она не так;


Чтобы сделать акцент на контурах тех или иных участках, примените бронзер;

  • не наносите основу на область под веками. Чтобы скрыть круги, возьмите консилер;
  • следите за сроком годности косметики. Просроченное средство ни в коем случае использовать нельзя.

https://youtube.com/watch?v=30dKTZKKZiY

Нужен ли праймер: за и против

Пользоваться праймером или нет — дело сугубо индивидуальное. Но следует заметить, что средство становится все более популярным не только из-за его способности создать эффект накладных ресниц, но также благодаря функции оздоровления и защиты. Не секрет, что современные туши в составе имеют немало химии, которую праймер помогает нейтрализовать или снизить ее негативное воздействие на структуру ресниц. Поэтому если ваши финансовые возможности позволяют такую покупку, отказываться от нее точно не стоит. Тем более что сегодня праймер имеется в косметичке у каждой модницы.

Lash-индустрия настолько прочно вошла в нашу жизнь, что нарощенные ресницы давно перестали быть диковинкой и пополнили ряды обыденных косметических процедур. Об ужасах отпавших ресниц и недолговечности результата можно услышать немало историй.

В чем причина? Ошибка мастера или некачественные материалы?

Обязательным пунктом, который содержит инструкция по наращиванию ресниц, является процедура их обезжиривания

Когда речь заходит об ошибках в вопросах наращивания ресниц, гуру lash-индустрии сразу же отмечают два фактора, неразрывно связанные с долговечностью – это качество косметической смолы и обезжиривателя.

Чем можно заменить дорогие грунтовки и праймеры, чтобы не отразилось на качестве?

Конечно, праймер или грунтовка, купленная в строительном магазине гораздо лучше по составу скрепления, в отличие от других средств.

Но, несмотря на это многие строители заменяют эти средства самодельным раствором, который отлично скрепляет слои шпаклевки или штукатурки.

Сегодня мы расскажем, что можно применить вместо грунтовки.

Что такое грунтовочное покрытие?

Без грунтовки сегодня не обойтись, в процессе выравнивания потолков и стен этот раствор наносят на поверхность, который скрепляет все составляющие. Раствор сделан на клеевой основе, поэтому является отличным закрепляющим средством.

Она упрочняет пористые и слабые основания, предотвращает пылеобразования, а также обеспечивает надежную адгезию с полимерными покрытиями на любых строительных поверхностях.

Важно! Грунтовку принято наносить на поверхность после шпаклевания стен и обработки поверхностей наждачной бумагой.

Разновидности грунтовки

Сегодня существует несколько видов грунтовочного покрытия, все зависит от типа покрываемой поверхности, влажности воздуха в помещении и предназначения состава.

Есть праймеры которыми покрывают стены между слоями шпаклевки для скрепления, а есть грунтовка которая необходима для закрепления уже проработанной поверхности.

Праймеры можно разделить на несколько типов,  а именно:

  • эпоксидные;
  • полиуретановые;
  • полиуретанцементые.

Каждая грунтовка имеет свое предназначение, перед ее покупкой следует обратить внимание на упаковку, на которой указано, для чего предназначен раствор. Можно подобрать праймер для особых климатических условий (при низкой температуре при  -30 и -50 градусов, а также в не вентилируемых помещениях).

Кроме того она предназначена для таких поверхностей, как бетон, черепица, шифер, дерево, камень, металл или битумные материалы.

Важно! Также грунтовка служит для того, чтобы защитить металл от заржавения, выявляет фактуру дерева, перекрывает крупные поры и другие дефекты поверхностей.

Чем можно заменить грунтовочное покрытие?

Грунтовку можно сделать самостоятельно в домашних условиях. Для этого понадобятся:

  • пол бруска хозяйственного мыла;
  • 1 часть медного купороса;
  • немного костного столярного клея;
  • ведро или миска.

Инструкция по приготовлению праймера:

  1. Необходимо в эмалированное ведро добавить воды и довести ее до кипения.
  2. С помощью терки нужно натереть мыло и добавить его в емкость.
  3. Огонь следует прикрутить и постоянно помешивать воду деревянной лопаткой.
  4. Теперь в раствор необходимо добавить столярный клей и медный купорос.
  5. Варить смешанные ингредиенты нужно 30 минут.
  6. После этого можно снять готовую грунтовку с плиты и поставить ее охлаждаться.

Важно! Раствор должен быть однородным, бледно-желтоватого оттенка и не иметь комочков.

Когда раствор остынет его можно применять. Эта смесь также имеет эффект закрепления и обеспечивает высокую адгезию любым поверхностям.

И второй рецепт, для которого необходим клей ПВА и вода. Следует взять 200 мл не холодной воды и добавить в нее 70 мл клея ПВА, ингредиенты следует тщательно размешать и раствор готов. Элементарный способ, как сделать грунтовку в домашних условиях.

Таким образом, можно заменить грунтовочное покрытие самодельными средствами.

Quick Change Prime Design Help

Введение

Программа разработки праймеров QuikChange® позволяет создавать праймеры для сайт-направленного мутагенеза (SDM), включая проекты как одно-, так и многосайтового мутагенеза. Программа предлагает последовательности праймеров в соответствии с руководящими принципами разработки праймеров набора QuikChange компании Stratagene и правилами, описанными ниже.

Дуплекс праймер-матрица, содержащий несовпадения, характеризуется более высокой свободной энергией, чем дуплекс без несовпадений. В этой программе свободная энергия рассчитывается методом ближайшего соседа для дуплексов нуклеиновых кислот. Несоответствия в дуплексе рассматриваются как внутренние петли и / или выпуклости, которые фланкируются ветвями идеально согласованной дуплексной ДНК. Полная свободная энергия дуплекса праймер-матрица представляет собой сумму энергий укладки оснований ближайших соседей плюс энергии петель, выступов и концевых «оборванных концов».«Значения свободной энергии ближайшего соседа взяты из программы mfold, версии 2.3 и адаптированы для гибридизации.

При разработке праймеров для мутагенеза нетранслируемой ДНК, включая нуклеотидные замены, делеции или вставки, программа конструирует праймеры достаточной длины и температуры плавления для включения желаемых мутаций.

Если необходимы аминокислотные замены в последовательности белка, программное обеспечение выбирает наиболее энергосберегающие изменения оснований, чтобы произвести замену аминокислот по вашему выбору.Предпочтение при замене кодона отдается кодону, который требует меньшего количества замен нуклеотидов или приводит к несовпадениям, способным к спариванию оснований (например, G-T). В дополнение к правилам сохранения энергии, в эту программу были включены несколько эмпирических правил относительно оптимальной замены кодонов, основанных на данных Stratagene с вырожденными праймерами1.

Дизайн грунтовки SDM

Принципы минимизации затрат на энергию

Дуплекс между ДНК-матрицей и праймером для сайт-направленного мутагенеза (SDM) является несовершенным.То есть он содержит одно или несколько несоответствий оснований или одноцепочечных сегментов (выпуклостей). Следовательно, свободная энергия несовпадающего дуплекса выше, чем у идеального дуплекса, то есть гипотетического дуплекса между ДНК-матрицей и полностью комплементарным олигонуклеотидом. Разница между свободной энергией несовпадающего дуплекса и соответствующего идеального дуплекса описывается как «Энергетическая стоимость» несовпадений.

                                        E0-E1
                                            Energy_Cost = ---------- * 100%
                                            E0

, где E0 представляет собой свободную энергию дуплекса «дикого типа», а E1 представляет собой свободную энергию дуплекса праймер-матрица мутагенеза.

Праймеры

разработаны с целью минимизировать свободную энергию несовпадающего дуплекса праймер-матрица, тем самым минимизируя затраты на энергию. В соответствии с принципами конструирования праймеров QuikChange несоответствия оснований должны располагаться близко к средней области праймера, чтобы менее стабильная область дуплекса праймер-матрица была фланкирована ветвями более стабильного дуплекса. Если требуется несколько событий дестабилизирующего спаривания оснований, то фланкирующие стабильные ветви праймера делают длиннее, чтобы компенсировать пониженную стабильность дуплекса и минимизировать затраты на энергию.

Общие рекомендации по использованию программного интерфейса QuikChange® Primer Design

Основной веб-интерфейс программы QuikChange Primer Design содержит несколько элементов управления вводом. Мы рекомендуем вам заполнять форму сверху вниз, начиная с выбора набора QuikChange, который вы используете.Последовательность ДНК (в формате обычного текста или FASTA) может быть введена либо путем выбора файла последовательности на локальном компьютере, либо путем ввода или вставки последовательности непосредственно в предоставленную текстовую область.

Последовательность может быть загружена либо как нетранслируемая последовательность ДНК, либо как транслированная последовательность белка, нажав соответствующую кнопку. Если требуется трансляция последовательности ДНК, можно указать необязательный диапазон трансляции. После загрузки последовательность отображается в виде серии флажков, соответствующих отдельным полимерным остаткам, что позволяет выбрать нужные позиции мутации.Для точечных мутаций используйте раскрывающиеся меню над флажками последовательности, чтобы указать тип изменения, необходимого для каждого из выбранных остатков. Для удаления или вставки выберите соответствующий переключатель под раскрывающимися меню точечной мутации. После того, как вся форма заполнена и все необходимые параметры установлены правильно, отправьте задание на проектирование на сервер для проверки и обработки, нажав кнопку Design Primers . Результаты возвращаются с отображением таблиц с названиями праймеров, последовательностями, температурами плавления, значениями свободной энергии праймер-матрица, расчетами затрат энергии и схемами дуплекса праймер-матрица.

Введение множественных мутаций

Множественные мутации, до семи областей, могут быть введены как в нетранслируемые последовательности ДНК, так и в белковые последовательности, либо путем конструирования одного праймера, который включает несколько точечных мутаций, либо путем создания нескольких праймеров, каждый из которых содержит одну мутацию (изменение основания или аминокислота замена, включающая одно или несколько базовых изменений).Последний подход приемлем, когда желаемые мутации далеко друг от друга. Его также можно применять к близкорасположенным мутациям, но мутагенез должен выполняться последовательно в несколько этапов.

Программа QuikChange Primer Design позволяет создать один праймер для одновременного введения нескольких точечных мутаций. Например, две аминокислоты, которые находятся рядом или разделены менее чем четырьмя остатками, можно заменить с помощью одного праймера со всеми необходимыми изменениями оснований, расположенными в его средней части и фланкирующих ответвлениях, которые являются достаточно длинными, чтобы гарантировать стабильность дуплекса и низкие затраты энергии.

Обратите внимание, что если для вашего эксперимента требуется несколько праймеров, программа автоматически предлагает использовать QuikChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kit, и все связанные свободные энергии рассчитаны для 65 ° C. В других наборах QuikChange используется более высокая температура расширения — 68 ° C. Если во время первоначальной настройки параметров был выбран другой набор QuikChange, но программа разработала более одного набора праймеров, то температура автоматически изменится на 65 ° C, и будет выдано соответствующее предупреждение.

Мутагенез нетранслированной последовательности ДНК

Базовые замены

Программное обеспечение может создавать праймеры для включения до семи нуклеотидных замен с помощью одного праймера.

  1. Загрузите последовательность, вставив текст или введя его в предоставленную текстовую область, или найдя файл, содержащий последовательность, с помощью кнопки Обзор .

    Примечания:

    • Все символы, отличные от «a», «c», «g» или «t» в последовательности, будут проигнорированы. Разрывы строк в последовательности также удаляются во время загрузки.
    • Последовательность может быть в формате FASTA или в виде обычного текста ASCII.
  2. Нажмите кнопку Загрузить сейчас .Программа отобразит серию флажков, каждая из которых соответствует одному «смысловому» нуклеотиду из последовательности ДНК.
  3. Выберите до семи нуклеотидов, которые вы хотите изменить, установив соответствующие флажки. Затем определите новые нуклеотиды, используя раскрывающиеся списки над областью флажка. Для замены одного нуклеотида используйте крайний левый раскрывающийся список (Сайт 1). Для двух или более изменений используйте соответствующий раскрывающийся список, начиная слева.Например, если требуются мутации 59t-> c и 63a-> t , тогда установите флажки 59t и 63a и выберите «c» в крайнем левом раскрывающемся списке (Сайт 1). и «т» во втором (площадка 2).
  4. Нажмите кнопку Design Primers . Программа вернет две таблицы, показывающие характеристики праймера, последовательность и схемы дуплекса праймер-матрица.

Исключения

Программа может создавать праймеры для создания небольших делеций в последовательности ДНК с использованием одного праймера.

  1. Загрузите последовательность, вставив текст или введя его в предоставленную текстовую область, или найдя файл, содержащий последовательность, с помощью кнопки Обзор .

    Примечания:

    • Все символы, отличные от «a», «c», «g» или «t» в последовательности, будут проигнорированы. Разрывы строк в последовательности также удаляются во время загрузки.
    • Последовательность может быть в формате FASTA или в виде обычного текста ASCII.
  2. Нажмите кнопку Загрузить сейчас . Программа отобразит серию флажков, каждая из которых соответствует одному «смысловому» нуклеотиду из последовательности ДНК.
  3. Установите переключатель Удалить нуклеотид или регион над флажками.
  4. Используя флажки, выберите два нуклеотида , непосредственно фланкирующих удаленную область, как показано ниже:
    • Последовательность:…acgtgctagctgcacgtacgtagctacgtagcccgatcgtagc …
    • Область для удаления: cacgta
    • Проверьте эти базы: … acgtgctagctgcacgtacgtagctacgtagcccgatcgtagc …
    Примечание:
    • Два проверенных нуклеотида не будут удалены
    • Если вы удаляете один нуклеотид, вы должны проверить два фланкирующих основания.
  5. Нажмите кнопку Design Primers . Программа откроет две таблицы со всеми характеристиками праймеров, последовательностями и схемами дуплекса праймер-матрица.

Вставки

Примечание. Это применимо только для наборов для сайт-направленного мутагенеза QuikChange, но не для набора для мультисайтового мутагенеза QuikChange.

Это программное обеспечение может создавать праймеры для создания небольших вставок в последовательность ДНК с использованием одного праймера.
Примечание: Текущая версия программного обеспечения хорошо работает с небольшими вставками (до 7 нуклеотидов). При более длинных вставках свободная энергия длинной вторичной структуры выпуклости может вносить значительный вклад в свободную энергию дуплекса праймер-матрица, и использование программного обеспечения для создания праймеров для таких длинных вставок не рекомендуется.

  1. Загрузите последовательность, вставив текст или введя его в предоставленную текстовую область, или найдя файл, содержащий последовательность, с помощью кнопки Обзор .

    Примечания:

    • Все символы, отличные от «a», «c», «g» или «t» в последовательности, будут проигнорированы. Разрывы строк в последовательности также удаляются во время загрузки.
    • Последовательность может быть в формате FASTA или в виде обычного текста ASCII.
  2. Нажмите кнопку Загрузить сейчас . Программа отобразит серию флажков, каждая из которых соответствует одному «смысловому» нуклеотиду из последовательности.
  3. Отметьте переключатель Insert между двумя отмеченными нуклеотидами и введите последовательность, которую нужно вставить.
  4. Используя флажки, выберите два нуклеотида , фланкирующих сайт вставки, как показано ниже.Между ними будет вставка:
    • Проверьте эти базы: … acgtgctagctgcacgtacgtagctacgtagcccgatcgtagc …
    • Область для вставки: cacgta
    • Результирующая последовательность: … acgtgctagctgcacgtacgtagctacgtagcccgatcgtagc …
    Примечание:
    • Два проверенных нуклеотида должны находиться рядом друг с другом
    • Установите переключатель слева от метки: «Вставить между двумя отмеченными нуклеотидами».
  5. Нажмите кнопку Design Primers . Программа откроет две таблицы со всеми характеристиками праймеров, последовательностями и схемами дуплекса праймер-матрица.

Аминокислотные замены в транслированной ДНК

Таблица генетических кодов

Универсальные правила трансляции ДНК приведены в таблице ниже.Имейте в виду, что разные организмы имеют разные предпочтения кодонов, которые можно найти в таблицах использования кодонов для конкретных видов. Праймеры, рекомендованные этой программой, оптимизированы для конкретного хозяина клонирования ( Escherichia coli ). Следовательно, они могут не соответствовать предпочтению использования кодонов организма, из которого произошел ген.

Т С A G
т TTT Phe (F)
TTC Phe (F)
TTA Le (L)
TTG Leu (L)		 TCT Se (S)
TCC Ser (S)
TCA Ser (S)
TCG Ser (S)		 TAT Tyr (Y)
TAC Tyr (Y)
TAA Ter (*)
Срок действия TAG (*)		 TGT Cys (C)
TGC Cys (C)
TGA Ter (*)
TGG Trp (Вт)
С CTT Le (L)
CTC Leu (L)
CTA Leu (L)
CTG Leu (L)		 CCT Pro (P)
CCC Pro (P)
CCA Pro (P)
CCG Pro (P)		 CAT His (H)
CAC His (H)
CAA Gln (Q)
CAG Gln (Q)		 CGT Arg (R)
CGC Arg (R)
CGA Arg (R)
CGG Arg (R)
А ATT Il (I)
ATC Ile (I)
ATA Ile (I)
ATG Met (M)		 ACT Thr (T)
ACC Thr (T)
ACA Thr (T)
ACG Thr (T)		 AAT Asn (N)
AAC Asn (N)
AAA Lys (K)
AAG Lys (K)		 AGT Ser (S)
AGC Ser (S)
AGA Arg (R)
AGG Arg (R)
Г GTT Val (V)
GTC Val (V)
GTA Val (V)
GTG Val (V)		 GCT Al (A)
GCC Ala (A)
GCA Ala (A)
GCG Ala (A)		 GAT Asp (D)
GAC Asp (D)
GAA Glu (E)
GAG Glu (E)		 GGT Gly (G)
GGC Gly (G)
GGA Gly (G)
GGG Gly (G)

Замена аминокислот и выбор кодонов

Эта программа позволяет быстро прогнозировать наиболее эффективные изменения оснований, которые приводят к желаемой аминокислотной замене.Алгоритм, используемый в этой программе, возвращает все возможные замены оснований для создания желаемой аминокислоты и присваивает баллы каждой возможности. Эти оценки определяются количеством нуклеотидов, которые необходимо изменить, и тем, приводит ли изменение к несоответствиям, способным к спариванию оснований (например, G / T). Эти оценки затем корректируются на основе эмпирических данных о смещении кодонов из экспериментов с вырожденными праймерами1. Мутация с наименьшей оценкой рекомендуется для вашего эксперимента по мутагенезу.

Это программное обеспечение может создавать праймеры для генерации до семи аминокислотных замен с помощью одного праймера.

  1. Загрузите последовательность, вставив текст или введя его в предоставленную текстовую область, или найдя файл, содержащий последовательность, с помощью кнопки Обзор .

    Примечания:

    • Все символы, отличные от «a», «c», «g» или «t» в последовательности, будут проигнорированы.Разрывы строк в последовательности также удаляются во время загрузки.
    • Последовательность может быть в формате FASTA или в виде обычного текста ASCII.
  2. Если вы не укажете необязательную область трансляции в последовательности ДНК, то будет выполнена только трансляция F1, в противном случае будет транслироваться только кадр 1 (F1) указанной области.Нажмите кнопку Перевести . При этом отобразится ряд флажков, каждый из которых будет соответствовать одному аминокислотному остатку из транслированной последовательности ДНК.
  3. Выберите до семи аминокислот, которые вы хотите изменить. Затем определите целевые остатки, используя раскрывающиеся списки под областью флажка. Для изменения одной аминокислоты используйте крайний левый раскрывающийся список; для двух или более изменений используйте соответствующие выпадающие списки, начиная слева.Например, если желаемые мутации — 25A-> R и 27T-> M , тогда вам необходимо установить флажки 25A и 27T и выбрать «R (arg)» в крайнем левом раскрывающемся списке. list и «M (met)» во втором.
  4. Нажмите кнопку Design Primers . Программа откроет две таблицы со всеми характеристиками праймеров, последовательностями и схемами дуплекса праймер-матрица.

Удаление аминокислот может быть выполнено путем удаления кодона из последовательности ДНК с использованием протокола удаления нуклеотидов.Эта программа не помогает специально вставлять аминокислоты из-за возможной неоднозначности генетического кода. Поэтому мы рекомендуем создавать праймеры для вставки аминокислот, работая с нетранслируемой последовательностью ДНК и используя однозначные кодоны для необходимой вставки.

Номер ссылки

1.Новорадовский, А. и др. (2005). Вычислительные принципы дизайна праймеров для сайт-направленного мутагенеза. Технические материалы конференции и выставки по нанотехнологиям NSTI 2005 г., Анахайм, 2005 г., стр. 532-535.

ОТКАЗ ОТ ОТВЕТСТВЕННОСТИ

Это программное обеспечение предназначено для бесплатного обслуживания сайт-направленного мутагенеза.Используя это программное обеспечение, такие пользователи принимают и соглашаются со следующим:

ДАННОЕ ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ПРЕДОСТАВЛЯЕТСЯ «КАК ЕСТЬ». ВСЕ ЯВНЫЕ ИЛИ ПОДРАЗУМЕВАЕМЫЕ УСЛОВИЯ, ЗАЯВЛЕНИЯ И ГАРАНТИИ, ВКЛЮЧАЯ, БЕЗ ОГРАНИЧЕНИЙ, ЛЮБЫЕ ПОДРАЗУМЕВАЕМЫЕ ГАРАНТИИ КОММЕРЧЕСКОЙ ПРИГОДНОСТИ, ПРИГОДНОСТИ ДЛЯ КОНКРЕТНОЙ ЦЕЛИ, ИЛИ НЕЗАЩИТЫ ИЛИ ЛЮБЫХ ПОДРАЗУМЕВАЕМЫХ ГАРАНТИЙ ИЛИ ЛЮБЫХ ПОДРАЗУМЕВАЕМЫХ ГАРАНТИЙ НАСТОЯЩИМ ИСКЛЮЧАЮТСЯ И НАСТОЯЩИМ ОТКАЗЫВАЮТСЯ ОТ ОТВЕТСТВЕННОСТИ В СТЕПЕНИ, РАЗРЕШЕННОЙ ПРИМЕНИМЫМ ЗАКОНОДАТЕЛЬСТВОМ.ЕДИНЫЙ АКТ О СДЕЛКАХ С КОМПЬЮТЕРНОЙ ИНФОРМАЦИЕЙ, ГДЕГО ПРИНЯЛ, НЕ ПРИМЕНЯЕТСЯ К ПРИОБРЕТЕНИЮ ИЛИ ИСПОЛЬЗОВАНИЮ ДАННОГО ПРОГРАММНОГО ОБЕСПЕЧЕНИЯ.

Инструмент для проектирования грунтовок

Введите номер доступа, gi или последовательность FASTA (Предпочтительна запись refseq) [?] Очистить

Введите здесь шаблон PCR (несколько шаблонов в настоящее время не поддерживаются).Настоятельно рекомендуется по возможности использовать регистрацию refseq или GI (а не исходную последовательность ДНК), так как это позволяет Primer-BLAST лучше идентифицировать матрицу и, таким образом, лучше проверять специфичность праймера.
Шаблон не требуется, если ниже указаны как прямой, так и обратный праймеры.
Длина шаблона ограничена 50 000 бит / с. Если ваш шаблон длиннее, вам необходимо использовать диапазон праймеров для ограничения длины (т. Е. Установите поля прямого праймера «От» и обратного праймера «До», но оставьте поля прямого праймера «До» и обратного праймера «От» пустыми) .


Или загрузите файл FASTA Спектр [?] Очистить

Из Чтобы

Прямая грунтовка

Обратный праймер

Введите диапазоны позиций, если вы хотите, чтобы праймеры располагались на определенных сайтах.Позиции относятся к номерам оснований на плюсовой цепи вашего шаблона (т. Е. Позиция «От» всегда должна быть меньше, чем позиция «До» для данного праймера). Допускаются частичные диапазоны. Например, если вы хотите, чтобы продукт ПЦР располагался между положением 100 и положением 1000 на шаблоне, вы можете установить прямой праймер «От» на 100 и обратный праймер «До» на 1000 (но оставьте прямой праймер «К» и обратная грунтовка «От» пустой).
Обратите внимание, что диапазон положений прямого праймера может не перекрываться с диапазоном положений обратного праймера.

PrimerX Documentation

I. Содержание

  1. Содержание
  2. Введение
  3. Дизайн грунтовки
    1. Дизайн праймера на основе последовательности ДНК
    2. Дизайн праймера на основе последовательности белка
    3. Вывод чтения
  4. Описание грунтовки
  5. О разработчиках
  6. О хозяине
  7. Информация об авторских правах
  8. Заявление об ограничении ответственности

II.Введение

PrimerX — это веб-программа, предназначенная для автоматизации разработки мутагенных праймеров ПЦР для сайт-направленного мутагенеза.

Сайт-направленный мутагенез, иногда называемый сайт-специфическим мутагенезом, представляет собой основанный на ПЦР метод, посредством которого специфические мутации вводятся в последовательность ДНК. Это достигается с помощью ПЦР-амплификации с использованием мутагенных олигонуклеотидных праймеров, которые уже содержат желаемую мутацию. Поскольку мутагенные праймеры включаются в каждую новую копию матричной ДНК во время ПЦР, результатом является амплификация новой мутированной последовательности ДНК.Однако, поскольку в отличие от праймеров в обычной ПЦР, мутагенные праймеры не идеально отжигаются с ДНК-матрицей, необходимо учитывать особые соображения относительно их конструкции. PrimerX разработан, чтобы помочь вам с этой задачей.

Для того, чтобы PrimerX генерировал мутагенные праймеры, необходимы две последовательности. Первый — это часть неизмененной матричной последовательности ДНК, содержащая целевой сайт для мутации. Вторая — это соответствующая последовательность ДНК или белка, которую вы хотите создать, уже содержащую желаемую мутацию.На основе этих последовательностей PrimerX сгенерирует список всех возможных пар праймеров, которые кодируют желаемую мутацию, и соблюдает набор ограничений, которые вы предоставляете.

PrimerX может генерировать праймеры на основе данных о последовательностях двух типов. Вы можете выбрать прямой ввод мутированной последовательности ДНК, включая вставки, делеции или замены желаемых пар оснований. Это рекомендуется для создания небольших базовых замен, вставок и удалений. Но настоящая сила PrimerX заключается в его способности генерировать праймеры на основе мутированной белковой последовательности.Используя эту опцию, вы можете вносить изменения в последовательность белка, кодируемую введенным шаблоном ДНК. Затем PrimerX генерирует праймеры на основе всех возможных последовательностей ДНК, которые могут кодировать желаемое изменение с учетом вырожденности кодонов. Это рекомендуется для генерации мутаций в генах, особенно когда намереваются заменить одну аминокислоту на другую или вставить стоп-кодон.

PrimerX также позволяет задавать спецификации для прямого и обратного праймеров отдельно, что позволяет легко конструировать пары праймеров для самых разных протоколов.Вам также предоставляется контроль над такими переменными, как содержание GC, температура плавления, длина областей, фланкирующих мутацию, и общую длину праймера. Кроме того, он может автоматически генерировать праймеры для трех коммерчески доступных протоколов мутагенеза: QuikChange ™ и ExSite ™ Site-Directed Mutagenesis Kits от Stratagene®; и система сайт-направленного мутагенеза GeneTailor ™ от Invitrogen ™.

Наконец, PrimerX включает простое приложение, которое может характеризовать созданные вами мутагенные праймеры.С помощью этого инструмента все, что вам нужно сделать, это ввести последовательность мутагенного праймера и количество несовпадающих оснований, и PrimerX сообщит его длину, температуру плавления, содержание GC и т. Д.

Вернуться к началу

III. Праймер Дизайн

A. Дизайн праймера на основе последовательности ДНК

Шаг 1:

На этом этапе вы просто должны ввести часть последовательности ДНК-шаблона. PrimerX требует только, чтобы эта последовательность содержала целевой сайт для мутации, фланкированный последовательностью матрицы достаточной длины.В большинстве случаев 50 п.н. с целевым сайтом в центре более чем достаточно.

У вас есть два варианта ввода последовательности ДНК-шаблона. Во-первых, вы можете загрузить файл, нажав «Обзор», чтобы открыть меню загрузки файла. Это позволяет вам найти и выбрать текстовый файл, содержащий последовательность ДНК-шаблона. Во-вторых, вы можете напрямую ввести или вставить последовательность шаблонов в текстовую область под полем для загрузки файлов. В обоих случаях вы можете ввести необработанную последовательность ДНК или последовательность в формате Fasta.

PrimerX нечувствителен к регистру; ввод «GCATGAG» аналогичен вводу «gcatgag». Кроме того, хотя PrimerX может принимать последовательности ДНК в формате Fasta и автоматически удаляет однострочный заголовок, начинающийся с «>», он также удаляет последовательность ДНК любого символа, который ему не принадлежит. Другими словами, любая буква, отличная от C, G, A или T, в вашей последовательности ДНК-шаблона будет автоматически удалена, как и любое число, пробел или специальный символ. Это означает, что вы можете вставлять последовательности в других форматах, таких как часть последовательности файла GenBank (после строки ORIGIN), и PrimerX автоматически удалит числа и пробелы.

Шаг 2:

Здесь вас попросят ввести простой код, идентифицирующий желаемую мутацию. Этот шаг не является обязательным; если вы пропустите этот шаг, вы можете позже вручную ввести желаемую мутацию в последовательность шаблона. Однако это может быть утомительно, особенно если вы ввели длинную последовательность. Ввод простого кода мутации на этом этапе может сэкономить вам немного хлопот.

Код мутации, который вы должны ввести, представляет собой упрощенный вариант номенклатуры, предложенной ден Данненом и Антонаракисом для описания вариаций последовательностей на уровне белка (Hum Genet 109 (1): 121-124, 2001).Мы разработали этот вариант отчасти потому, что любому, кто плохо знаком с PrimerX, его будет легко изучить.

Код мутации состоит из последовательности одной или нескольких букв, числа и, наконец, одной или нескольких дополнительных букв. Первая часть обозначает базу (и), которую вы хотите изменить, либо путем замены на другую базу, удаления или вставки другой базы в эту позицию, чтобы она была перемещена в более позднюю позицию. Число обозначает числовую позицию этой базы в предоставленной вами последовательности шаблонов.Последняя последовательность букв обозначает изменение, которое вы хотите внести. Если вы желаете замены, она должна состоять из базовых элементов, которые вы хотите заменить исходными. Если вы хотите произвести удаление, это должны быть буквы «del». Если требуется вставка, она должна состоять из букв «ins», за которыми следует основание (и), которое вы хотите вставить. Примеры приведены ниже.

Тип мутации Код мутации Описание
Замена C15G Заменяет букву «C» в позиции 15 на букву «G».
CG15AT Заменяет «CG» в позициях 15-16 на «AT».
Удаление C15del Удаляет букву «C» в позиции 15.
CG15del Удаляет «CG» в позициях 15-16.
Вставка C15insG Вставляет букву «G» в позицию 15, сдвигая «C» в позицию 16.
CG15insAT Вставляет «AT» в позиции 15-16, перемещая «CG» в позиции 17-18.

Код мутации нечувствителен к регистру, не имеет значения, вводятся ли основания или аффиксы «del» или «ins» в верхнем или нижнем регистре. Однако мы рекомендуем использовать формат, показанный в примере выше, для облегчения интерпретации. Если вы допустили ошибку при вводе кода мутации и он не может быть интерпретирован программой, сообщение об ошибке появится позже при идентификации ошибки.

Шаг 3:

На этом этапе вас просят ввести протокол мутагенеза, для которого вы хотите разработать мутагенные праймеры. Во всех случаях будут предоставлены параметры по умолчанию, однако вы можете изменить их по своему усмотрению. Возможны следующие варианты:

Определяется пользователем (базовый)
Выбор этого параметра позволит вам вручную указать простые спецификации, описывающие тип грунтовки, который вам нужен. Параметры, которые вас попросят ввести, будет легко понять, однако вы не сможете определить прямой и обратный праймеры отдельно.Любая пара праймеров, созданная таким образом, будет либо комплементарной, либо перекрывающейся и симметричной.
Определяется пользователем (расширенный)
Эта опция также позволит вам создать желаемую пару праймеров. Вы сможете отдельно установить параметры для прямого и обратного праймеров. Кроме того, вы сможете установить расстояние обратного праймера от мутации; обратный праймер не обязательно будет содержать мутацию.
Набор для сайт-направленного мутагенеза QuikChange ™ от Stratagene®
Параметры по умолчанию, соответствующие этому протоколу, будут введены за вас.Праймеры будут дополнительными, с мутацией в центре.
Набор для сайт-направленного мутагенеза ExSite ™ от Stratagene®
Параметры по умолчанию, соответствующие этому протоколу, будут введены за вас. Праймеры не будут перекрываться; мутация будет на 5′-конце прямого праймера.
Система сайт-направленного мутагенеза GeneTailor ™ от Invitrogen ™
Параметры по умолчанию, соответствующие этому протоколу, будут введены за вас.Праймеры будут перекрываться, при этом мутация будет происходить только в прямом праймере.

Шаг 4:

Ваша задача на этом шаге будет зависеть от того, решили ли вы ввести код мутации на шаге 2. Если да, то вам просто нужно будет проверить, является ли мутированная последовательность, сгенерированная программой на основе вашего кода мутации. что вы желаете. Если это действительно ваша желаемая последовательность, вам нужно только перейти к шагу 5. Но если последовательность, сгенерированная программой, неверна, нажмите кнопку «Назад» в вашем браузере и повторно введите код мутации.

Однако, если вы пропустили шаг 2, просто измените последовательность шаблонов в текстовой области на ту, которую вы хотите создать. Например, если вы хотите заменить «..GCGTGCG ..» на «..GCGAGCG ..», просто удалите букву T и введите вместо нее букву A. Однако есть несколько вещей, которые следует помнить при вводе мутации:

  • Вы должны ввести только желаемой мутации. Больше ничего не меняйте, иначе PrimerX решит, что это часть желаемой мутации, и может столкнуться с вычислительными ошибками.
  • Введите только вставки, удаления или замены ИЛИ; не вводите комбинации из трех. Например, не вставляйте G, а затем заменяйте соседний C другим G. (например, «..CCC ..» -> «..CGGC ..»). Поскольку база была добавлена, PrimerX интерпретирует это как вставка только одной базы и соответствующие вычисления.
  • Не вводите мутацию более чем в один сайт в последовательности. Например, не производите замену в одном сайте, а затем другую замену пятью парами оснований ниже по течению.PrimerX будет интерпретировать всю последовательность между ними как часть мутации.

В некоторых случаях в текстовой области для этого шага может отображаться сообщение, а не последовательность ДНК. В сообщении будет указана ошибка, которую вы могли сделать на предыдущем шаге. Затем вам просто нужно нажать кнопку «Назад» в браузере и исправить ошибку.

Шаг 5:

На этом последнем этапе вас просят ввести набор параметров, описывающих желаемую пару праймеров.Список отображаемых параметров будет зависеть от протокола, который вы выбрали на шаге 3. Например, если вы выбрали «Определяемый пользователем (базовый)», вы увидите здесь один список параметров, позволяющий определять прямой и обратный праймеры вместе. . Но если вы выберете «Пользовательский (расширенный)», вы увидите здесь два отдельных списка: один для настройки прямого праймера, а другой — для настройки обратного праймера. Если вы выбрали один из трех коммерческих протоколов, отображаемые здесь значения по умолчанию будут теми, которые рекомендуются для желаемого протокола.

Большинство этих параметров требуют от вас определения диапазона допустимых значений путем назначения минимума и максимума. Ниже приводится список параметров:

  • Температура плавления (° C) — Это относится к температуре плавления (Tm), допустимой для вашей реакции ПЦР. Температура плавления рассчитывается по следующей формуле:

    Tm = 81,5 + 0,41 (% GC) — 675 / N -% несоответствия
    где N = длина праймера в парах оснований,
    а значения для% GC и% несоответствия — целые числа.

    Или для вставок и удалений:

    Tm = 81,5 + 0,41 (% GC) — 675 / N
    где N не включает вставляемые / удаляемые базы.

  • Содержание GC (%) — Это относится к допустимому содержанию GC в ваших праймерах, рассчитанному в процентах по всей длине праймера. Если это значение не имеет значения, просто установите диапазон от 0 до 100.
  • Длина праймера (п.о.) — Это относится к общей длине праймера, включая желаемую мутацию.
  • 5 ‘фланкирующая область (п.н.) — Это относится к длине части вашего праймера, которая находится слева от мутированной области, когда последовательность читается от 5′ до 3 ‘.
  • 3 ‘фланкирующая область (п.н.) — Это относится к длине части вашего праймера, которая находится справа от мутированной области, когда последовательность читается от 5′ до 3 ‘.
  • Праймеры оканчиваются на G или C. — Проверка этого гарантирует, что ваши праймеры имеют зажим GC, что просто означает, что как прямой, так и обратный праймеры имеют по крайней мере один G или C на 3 ‘конце.
  • Прямой / обратный праймер оканчивается на G или C. — Проверка любого из них гарантирует, что соответствующий праймер будет иметь по крайней мере один G или C на 3′-конце во всех созданных парах праймеров.
  • Сайт мутации в центре праймера. — Проверка этого гарантирует, что мутированная область находится в центре праймера. В PrimerX это означает, что длины 5 ‘и 3’ фланкирующих областей различаются не более чем на одну пару оснований.
  • Расстояние от мутации — Это относится к расстоянию в парах оснований от первой мутированной пары оснований в прямом праймере до 5′-конца обратного праймера, когда две последовательности выровнены по их комплементарным областям.Используйте отрицательные значения для обозначения восходящего направления (слева) от мутированной пары оснований и положительные значения для нисходящего направления (справа).
  • Комплементарные праймеры — Когда этот параметр выбран, значения, введенные вами для длины фланкирующей области 5 ‘и 3’, будут применяться только к прямому праймеру. Сгенерированные обратные праймеры затем будут представлены просто как обратный комплемент их соответствующих прямых праймеров.
  • Перекрывающиеся праймеры — Когда этот параметр выбран, значения, которые вы ввели для длины фланкирующей области 5 ‘и 3’, будут применяться как к прямым, так и к обратным праймерам.В каждой паре праймеров два праймера будут иметь одинаковую длину фланкирующей области 5 ‘и 3’. Содержание ГХ, температура плавления и местоположение будут сообщаться отдельно для каждого праймера.

Есть некоторые вещи, которые следует учитывать при установке этих ограничений. В частности, следует позаботиться о том, чтобы не создавать противоречий в своих ценностях. Например, минимальное значение не должно быть больше соответствующего максимального значения. Кроме того, при выборе «Сайт мутации в центре праймера» диапазоны, которые вы устанавливаете для 5 ‘и 3’ фланкирующих областей, должны перекрываться (или, что еще лучше, быть идентичными).В противном случае было бы невозможно получить праймеры. Ввод этих противоречий приведет к появлению сообщения об ошибке с указанием проблемы.

Вам также следует иметь в виду, что когда «Сайт мутации в центре праймера» равен , а не выбран , диапазоны, которые вы определяете для длин 5 ‘и 3’ фланкирующих областей, должны быть уже, чем значения по умолчанию. Это связано с тем, что длины фланкирующих областей больше не ограничиваются приблизительно равными. Установка широких диапазонов для обоих из них приведет к тому, что PrimerX будет вычислять, возможно, сотни потенциальных праймеров, замедляя работу сервера и, вероятно, выводя слишком много результатов, чтобы быть полезными.Максимального диапазона в 5 п.н. для каждого должно быть достаточно.

Вернуться к началу

B. Дизайн праймера на основе последовательности белка

Шаг 1:

На этом этапе вы должны ввести часть последовательности ДНК-шаблона, которая кодирует целевые аминокислоты, подлежащие мутации. Целевой сайт должен быть фланкирован с обеих сторон последовательностью матрицы достаточной длины. Кроме того, последовательность ДНК, которую вы вводите, должна происходить от смысловой цепи и начинаться в правильной рамке считывания, чтобы программа могла правильно ее транслировать.Обычно достаточно ввода около 50 п.н.

Как упоминалось ранее, у вас есть два варианта ввода последовательности ДНК-шаблона. Во-первых, вы можете загрузить файл, нажав «Обзор», чтобы открыть меню загрузки файла. Это позволяет вам найти и выбрать текстовый файл, содержащий последовательность ДНК-шаблона. Во-вторых, вы можете напрямую ввести или вставить последовательность шаблонов в текстовую область под полем для загрузки файлов. В обоих случаях вы можете ввести необработанную последовательность ДНК или последовательность в формате Fasta.

PrimerX нечувствителен к регистру; ввод «GCATGAG» аналогичен вводу «gcatgag». Кроме того, хотя PrimerX может принимать последовательности ДНК в формате Fasta и автоматически удаляет однострочный заголовок, начинающийся с «>», он также удаляет последовательность ДНК любого символа, который ему не принадлежит. Другими словами, любая буква, отличная от C, G, A или T, в вашей последовательности ДНК-шаблона будет автоматически удалена, как и любое число, пробел или специальный символ. Это означает, что вы можете вставлять последовательности в других форматах, таких как часть последовательности файла GenBank (после строки ORIGIN), и PrimerX автоматически удалит числа и пробелы.

Нажатие на «Перевести» должно вызвать отображение соответствующей белковой последовательности в текстовой области на шаге 2.

Шаг 2:

На этом этапе вам просто нужно проверить, смог ли PrimerX правильно транслировать последовательность ДНК, которую вы ввели ранее, в соответствующую последовательность белка. Результирующая последовательность белка также должна содержать целевые аминокислоты, подлежащие мутации.

Вот список буквенных символов для различных аминокислот.

«А» = аланин
«C» = цистеин
«D» = аспарагиновая кислота
«E» = глутаминовая кислота
«F» = фенилаланин
«G» = Глицин
«H» = гистидин
«I» = изолейцин
«К» = лизин
«L» = лейцин
«M» = метионин / Start
«N» = аспарагин
«P» = Proline
«Q» = глутамин
«R» = аргинин
«S» = серин
«T» = треонин
«V» = валин
«W» = триптофан
«Y» = тирозин
«_» = Стоп-кодон

Шаг 3:

Здесь вас попросят ввести простой код, идентифицирующий желаемую мутацию.Этот шаг не является обязательным; Если вы пропустите этот шаг, вы можете позже вручную ввести желаемую мутацию в последовательность белка. Однако это может быть утомительно, особенно если вы ввели длинную последовательность. Ввод простого кода мутации на этом этапе может сэкономить вам немного хлопот.

Код мутации, который вы должны ввести, представляет собой упрощенный вариант номенклатуры, предложенной ден Данненом и Антонаракисом для описания вариаций последовательностей на уровне белка (Hum Genet 109 (1): 121-124, 2001).Мы разработали этот вариант отчасти потому, что любому, кто плохо знаком с PrimerX, его будет легко изучить.

Код мутации состоит из последовательности одной или нескольких букв, числа и, наконец, одной или нескольких дополнительных букв. Первая часть обозначает аминокислоты, которые вы хотите изменить, либо путем замены другой аминокислотой, либо путем делеции, либо вставки другой аминокислоты в это положение, чтобы она была перемещена в более позднее положение. Число обозначает числовое положение этой аминокислоты в последовательности белка.Последняя последовательность букв обозначает изменение, которое вы хотите внести. Если вы желаете замены, она должна состоять из аминокислот, которые вы хотите заменить исходной (-ыми). Если вы хотите произвести удаление, это должны быть буквы «del». Если требуется вставка, она должна состоять из букв «ins», за которыми следует аминокислота (аминокислоты), которую вы хотите вставить. Примеры приведены ниже.

Тип мутации Код мутации Описание
Замена E15P Заменяет «E» в позиции 15 на «P».
EF15PQ Заменяет «EF» в позициях 15–16 на «PQ».
Удаление E15del Удаляет букву «E» в позиции 15.
EF15del Удаляет «EF» в позициях 15-16.
Вставка E15insP Вставляет букву «P» в позицию 15, перемещая «E» в позицию 16.
EF15insPQ Вставляет «PQ» в позиции 15-16, перемещая «EF» в позиции 17-18.

Код мутации нечувствителен к регистру, не имеет значения, вводятся ли основания или аффиксы «del» или «ins» в верхнем или нижнем регистре. Однако мы рекомендуем использовать формат, показанный в примере выше, для облегчения интерпретации. Если вы допустили ошибку при вводе кода мутации и он не может быть интерпретирован программой, сообщение об ошибке появится позже при идентификации ошибки.

Шаг 4:

На этом этапе вас просят ввести протокол мутагенеза, для которого вы хотите разработать мутагенные праймеры. Во всех случаях будут предоставлены параметры по умолчанию, однако вы можете изменить их по своему усмотрению. Возможны следующие варианты:

Определяется пользователем (базовый)
Выбор этого параметра позволит вам вручную указать простые спецификации, описывающие тип грунтовки, который вам нужен. Параметры, которые вас попросят ввести, будет легко понять, однако вы не сможете определить прямой и обратный праймеры отдельно.Любая пара праймеров, созданная таким образом, будет либо комплементарной, либо перекрывающейся и симметричной.
Определяется пользователем (расширенный)
Эта опция также позволит вам создать желаемую пару праймеров. Вы сможете отдельно установить параметры для прямого и обратного праймеров. Кроме того, вы сможете установить расстояние обратного праймера от мутации; обратный праймер не обязательно будет содержать мутацию.
Набор для сайт-направленного мутагенеза QuikChange ™ от Stratagene®
Параметры по умолчанию, соответствующие этому протоколу, будут введены за вас.Праймеры будут дополнительными, с мутацией в центре.
Набор для сайт-направленного мутагенеза ExSite ™ от Stratagene®
Параметры по умолчанию, соответствующие этому протоколу, будут введены за вас. Праймеры не будут перекрываться; мутация будет на 5′-конце прямого праймера.
Система сайт-направленного мутагенеза GeneTailor ™ от Invitrogen ™
Параметры по умолчанию, соответствующие этому протоколу, будут введены за вас.Праймеры будут перекрываться, при этом мутация будет происходить только в прямом праймере.

Шаг 5:

Ваша задача на этом шаге будет зависеть от того, решили ли вы ввести код мутации на шаге 3. Если да, то вам просто нужно будет проверить, является ли мутированная последовательность, сгенерированная программой на основе вашего кода мутации. что вы желаете. Если это действительно ваша желаемая последовательность, вам нужно только перейти к шагу 6. ​​Но если последовательность, сгенерированная программой, неверна, нажмите кнопку «Назад» в вашем браузере и повторно введите код мутации.

Однако, если вы пропустили шаг 3, просто измените последовательность шаблонов в текстовой области на ту, которую вы хотите создать. Например, если вы хотите заменить «..EFLQLMN ..» на «..EFLRLMN ..», просто удалите Q и введите R вместо него. Однако есть несколько вещей, которые следует помнить при вводе мутации:

  • Вы должны ввести только желаемой мутации. Больше ничего не меняйте, иначе PrimerX решит, что это часть желаемой мутации, и может столкнуться с вычислительными ошибками.
  • Введите только вставки, удаления или замены ИЛИ; не вводите комбинации из трех. Например, не вставляйте Q, а затем заменяйте соседний I другим Q (например, «..LIL ..» -> «..LQQL ..») Поскольку была добавлена ​​аминокислота, PrimerX интерпретирует это как вставка только одной базы, и соответственно произвести ее вычисления.
  • Не вводите мутацию более чем в один сайт в последовательности. Например, не делайте замену в одном сайте, а затем другую замену на расстоянии пяти аминокислот.PrimerX будет интерпретировать всю последовательность между ними как часть мутации.

В некоторых случаях в текстовой области для этого шага может отображаться сообщение, а не последовательность белка. В сообщении будет указана ошибка, которую вы могли сделать на предыдущем шаге. Затем вам просто нужно нажать кнопку «Назад» в браузере и исправить ошибку.

Шаг 6:

На этом последнем этапе вас просят ввести набор параметров, описывающих желаемую пару праймеров.Список отображаемых параметров будет зависеть от протокола, который вы выбрали на шаге 3. Например, если вы выбрали «Определяемый пользователем (базовый)», вы увидите здесь один список параметров, позволяющий определять прямой и обратный праймеры вместе. . Но если вы выберете «Пользовательский (расширенный)», вы увидите здесь два отдельных списка: один для настройки прямого праймера, а другой — для настройки обратного праймера. Если вы выбрали один из трех коммерческих протоколов, отображаемые здесь значения по умолчанию будут теми, которые рекомендуются для желаемого протокола.

Большинство этих параметров требуют от вас определения диапазона допустимых значений путем назначения минимума и максимума. Ниже приводится список параметров:

  • Система экспрессии — Здесь вы можете выбрать из списка обычно используемых модельных организмов, используемых в молекулярной и клеточной биологии. Если вы выберете один из них, PrimerX будет генерировать праймеры на основе оптимального использования кодонов этим организмом. Например, если вы хотите вставить остаток глицина и выразить его в бактерии E.coli , PrimerX будет генерировать праймеры, в которых остаток глицина кодируется кодоном GGC, который является кодоном, наиболее часто используемым E.coli для кодирования глицина. Это увеличивает шансы того, что желаемая мутация будет правильно выражена организмом, с которым вы работаете.
    Если организм, с которым вы работаете, не включен в список, вы можете использовать Codon Usage Analyzer, чтобы помочь вам определить правильный кодон для использования.
  • Температура плавления (° C) — Это относится к температуре плавления (Tm), допустимой для вашей реакции ПЦР.Температура плавления рассчитывается по следующей формуле:

    Tm = 81,5 + 0,41 (% GC) — 675 / N -% несоответствия
    где N = длина праймера в парах оснований,
    а значения для% GC и% несоответствия — целые числа.

    Или для вставок и удалений:

    Tm = 81,5 + 0,41 (% GC) — 675 / N
    где N не включает вставляемые / удаляемые базы.

  • Содержание GC (%) — Это относится к допустимому содержанию GC в ваших праймерах, рассчитанному в процентах по всей длине праймера.Если это значение не имеет значения, просто установите диапазон от 0 до 100.
  • Длина праймера (п.о.) — Это относится к общей длине праймера, включая желаемую мутацию.
  • 5 ‘фланкирующая область (п.н.) — Это относится к длине части вашего праймера, которая находится слева от мутированной области, когда последовательность читается от 5′ до 3 ‘.
  • 3 ‘фланкирующая область (п.н.) — Это относится к длине части вашего праймера, которая находится справа от мутированной области, когда последовательность читается от 5′ до 3 ‘.
  • Праймеры оканчиваются на G или C. — Проверка этого гарантирует, что ваши праймеры имеют зажим GC, что просто означает, что как прямой, так и обратный праймеры имеют по крайней мере один G или C на 3 ‘конце.
  • Прямой / обратный праймер оканчивается на G или C. — Проверка любого из них гарантирует, что соответствующий праймер будет иметь по крайней мере один G или C на 3′-конце во всех созданных парах праймеров.
  • Сайт мутации в центре праймера. — Проверка этого гарантирует, что мутированная область находится в центре праймера.В PrimerX это означает, что длины 5 ‘и 3’ фланкирующих областей различаются не более чем на одну пару оснований.
  • Расстояние от мутации — Это относится к расстоянию в парах оснований от первой мутированной пары оснований в прямом праймере до 5′-конца обратного праймера, когда две последовательности выровнены по их комплементарным областям. Используйте отрицательные значения для обозначения восходящего направления (слева) от мутированной пары оснований и положительные значения для нисходящего направления (справа).
  • Комплементарные праймеры — Когда этот параметр выбран, значения, введенные вами для длины фланкирующей области 5 ‘и 3’, будут применяться только к прямому праймеру. Сгенерированные обратные праймеры затем будут представлены просто как обратный комплемент их соответствующих прямых праймеров.
  • Перекрывающиеся праймеры — Когда этот параметр выбран, значения, которые вы ввели для длины фланкирующей области 5 ‘и 3’, будут применяться как к прямым, так и к обратным праймерам. В каждой паре праймеров два праймера будут иметь одинаковую длину фланкирующей области 5 ‘и 3’.Содержание ГХ, температура плавления и местоположение будут сообщаться отдельно для каждого праймера.

Есть некоторые вещи, которые следует учитывать при установке этих ограничений. В частности, следует позаботиться о том, чтобы не создавать противоречий в своих ценностях. Например, минимальное значение не должно быть больше соответствующего максимального значения. Кроме того, при выборе «Сайт мутации в центре праймера» диапазоны, которые вы устанавливаете для 5 ‘и 3’ фланкирующих областей, должны перекрываться (или, что еще лучше, быть идентичными).В противном случае было бы невозможно получить праймеры. Ввод этих противоречий приведет к появлению сообщения об ошибке с указанием проблемы.

Вам также следует иметь в виду, что когда не выбран «Сайт мутации в центре праймера», диапазоны, которые вы определяете для длин фланкирующих областей 5 ‘и 3’, должны быть уже, чем значения по умолчанию. Это связано с тем, что длины фланкирующих областей больше не ограничиваются приблизительно равными. Установка широких диапазонов для обоих из них приведет к тому, что PrimerX будет вычислять, возможно, сотни потенциальных праймеров, замедляя работу сервера и, вероятно, выводя слишком много результатов, чтобы быть полезными.Максимального диапазона в 5 п.н. для каждого должно быть достаточно.

Вернуться к началу

C. Чтение вывода

Щелчок по «Сгенерировать праймеры» заставит PrimerX отобразить вычисленные результаты на экране. Страница результатов будет состоять из двух частей: отображение представленных вами последовательностей ДНК и список праймеров, созданных программой.

Каждая последовательность ДНК отображается в строках по 50 п.н. Над верхней линией вы должны увидеть 4 равномерно расположенные точки («.»). Они совпадают с 10-й, 20-й, 30-й и 40-й парой оснований в каждой строке, что упрощает поиск позиций в последовательности.

Далее следует список введенных вами параметров. Это поможет вам отслеживать несколько наборов результатов.

Ниже вы увидите подсчет общего количества сгенерированных пар праймеров, за которым следует список этих пар праймеров. Когда выбраны «Комплементарные праймеры», каждая пара отображается как прямая последовательность и ее обратный комплемент.Когда выбрано «Перекрывающиеся праймеры» или если вы выбрали протокол, требующий, чтобы прямой и обратный праймеры создавались отдельно, праймеры отображаются антипараллельным образом с выравниванием их комплементарных участков.

Выше и ниже каждой пары праймеров находится один или несколько символов. Если вы видите одну или несколько звездочек («*»), то введенная вами мутация является заменой или вставкой, а звездочки будут находиться непосредственно над и под замененными или вставленными основаниями. Символы «\ /» и «/ \» означают, что вы ввели удаление; они указывают на положение, в котором была удалена часть последовательности шаблона.

Под каждой парой праймеров отображается основная информация. К ним относятся следующие:

  • GC Content — показывает процентное содержание оснований G и C в последовательности праймера.
  • Температура плавления — Это дает расчетную температуру плавления, основанную на формуле, приведенной выше. Это только приблизительное значение и может быть неточным в реальной реакции ПЦР.
  • Длина — длина каждого праймера в парах оснований.
  • Местоположение — Это дает начальное и конечное положения в исходной (немутированной) матричной последовательности, которая соответствует последовательности праймера.
  • 5′- и 3′-фланкирующие области — Они определяют длины областей, фланкирующих мутированный сайт в последовательности прямого праймера.
  • Прямой и обратный праймеры MW — Они дают молекулярные массы соответствующих одноцепочечных олигонуклеотидных праймеров в дальтонах, которые рассчитываются по следующей формуле:

    МВт = (313.21 x нА) + (304,20 x нТл) + (329,21 x нГс) +
    (289,19 x нКл) + 18,02 — 80,00
    где: nA = количество оснований аденина, nT = количество
    тиминовые основания и др.

    Предполагается, что 5′-конец праймера не фосфорилируется, что обычно имеет место.
  • Несоответствующие основания — Это подсчет количества пар оснований, которые были удалены, вставлены или заменены.
  • Мутация — определяет, была ли мутация делецией, вставкой или заменой.

Если PrimerX не может сгенерировать праймеры, появится сообщение об ошибке, в котором будут содержаться рекомендации о том, что вы можете сделать для решения проблемы. Если эта или другая проблема не исчезнет, ​​напишите мне.

Вернуться к началу

IV. Описание грунтовки

Эта особенность PrimerX на самом деле не требует пояснений. В текстовом поле «Последовательность праймера» введите прямую последовательность созданного вами праймера. В текстовом поле с надписью «Несоответствующие базы» введите количество баз, которые были изменены по сравнению с исходной последовательностью.После этого выберите, является ли желаемая мутация заменой, вставкой или удалением. Когда вы нажимаете «Отправить», PrimerX вычислит и сообщит обратный комплемент, длину, температуру плавления, содержание GC, молекулярную массу и процент несоответствия последовательности, а также то, заканчивается ли последовательность буквой G или C.

Эта функция была разработана, чтобы помочь вам в разработке ваших собственных мутагенных праймеров, а не для выбора пары праймеров на основе результатов, полученных в функциях дизайна праймеров.Когда мы добавляли эту функцию, у нас был протокол сайт-направленного мутагенеза QuikChange ™ компании Stratagene®. Для тех, кто использует этот протокол, вот рекомендации, рекомендованные Stratagene:

  • Грунтовки должны иметь длину от 25 до 45 оснований.
  • Температура плавления должна быть больше или равна 78 ° C согласно формуле, приведенной ранее.
  • Желаемая мутация должна находиться в середине праймера с ~ 10-15 основаниями правильной последовательности с обеих сторон.
  • Последовательность должна иметь содержание GC по крайней мере 40% и должна оканчиваться одним или несколькими основаниями C или G.

Вернуться к началу

В. О разработчиках

Карло Лапид в настоящее время учится в аспирантуре Национального института молекулярной биологии и биотехнологии (NIMBB) при университете. Филиппин, Дилиман. Он окончил со степенью бакалавра в области молекулярной биологии и биотехнологии в апреле 2003 года и в настоящее время получает степень магистра. степень в той же области. Он также является научным сотрудником Института морских наук при Филиппинском университете.Ему можно написать по электронной почте [email protected].

Он начал писать PrimerX как необходимый проект для вводного курса биоинформатики. Однако ему очень понравилось работать над проектом. что он решил продолжить его обновление и улучшение.

Иминь Гао — студент третьего курса факультета компьютерных наук Филиппинского университета в Дилимане. Он В апреле 2002 г. окончил Филиппинский университет в Лос-Баньосе со степенью бакалавра компьютерных наук и сейчас принимает его степень магистра компьютерных наук, специализация — биоинформатика.Его можно отправить по электронной почте [email protected].

Вернуться к началу

VI. О хосте

Bioinformatics.Org — международная организация, которая продвигает свободу и открытость в области биоинформатики. Это достигается путем предоставления бесплатных и открытых ресурсов для исследований, разработок и образования, чтобы такие ресурсы можно было и дальше развивать. Организация является некоммерческой и поддерживает Интернет-сайт с тем же названием, где можно получить доступ к этим ресурсам.Bioinformatics.Org надеется снизить барьер для входа и участия в области биоинформатики, поскольку доступ к передовым ресурсам может быть непомерно дорогим для тех, кто работает индивидуально, в небольших группах, в плохо финансируемых учреждениях или в развивающихся странах.

Вернуться к началу

VII. Информация об авторских правах

PrimerX — автоматизированный дизайн мутагенных праймеров для сайт-ориентированных мутагенез
Авторские права © 2003 Карло Лапид

Вернуться к началу

VIII.Заявление об ограничении ответственности

Хотя мы, разработчики PrimerX, сделали все возможное, чтобы сделать PrimerX настолько полезным и мощным, насколько это возможно, мы не можем предложить никаких гарантий относительно эффективности или точности этой программы / веб-сайта. Не гарантируется, что праймеры, созданные с использованием PrimerX, будут работать в реальной реакции ПЦР или любой другой процедуре. Мы не несем ответственности за какие-либо проблемы, возникшие в результате использования этой программы.

PrimerX никоим образом не связан со Stratagene®, Invitrogen ™ или какой-либо другой частной компанией.Мы официально не поддерживаем наборы QuikChange ™, ExSite ™ или GeneTailor ™ Site-Directed Mutagenesis, а также любые другие продукты, продаваемые этими или любыми другими компаниями.

Вернуться к началу

Последнее изменение: 14 августа 2006 г.

reStructuredText Primer — документация по Sphinx 4.0.0+

reStructuredText — это язык разметки открытого текста по умолчанию, используемый Sphinx. Этот раздел — это краткое введение в концепции и синтаксис reStructuredText (reST), предназначен для предоставления авторам достаточной информации для составления документов продуктивно.Поскольку reST был разработан как простая ненавязчивая разметка язык, это не займет много времени.

См. Также

Авторитетная документация пользователя reStructuredText. Ссылки «ref» в этом ссылка на документ с описанием отдельных конструкций в reST Справка.

Пункты

Абзац (ref) — это самый основной блок в reST документ. Абзацы — это просто куски текста, разделенные одним или несколькими пробелами. линий. Как и в Python, в reST важен отступ, поэтому все строки тот же абзац должен быть выровнен по левому краю с тем же уровнем отступа.

Встроенная разметка

Стандартная встроенная разметка reST довольно проста: используйте

  • одна звездочка: * текст * для выделения (курсив),

  • две звездочки: ** текст ** для сильного выделения (жирный шрифт) и

  • обратные кавычки: `` текст '' для примеров кода.

Если в бегущем тексте появляются звездочки или обратные кавычки, и их можно спутать с встроенные разделители разметки, они должны быть экранированы обратной косой чертой.

Обратите внимание на некоторые ограничения этой разметки:

  • не может быть вложенным,

  • Содержимое

    не может начинаться или заканчиваться пробелом: * текст * неверно,

  • он должен отделяться от окружающего текста символами, не являющимися словами. Использовать обратная косая черта экранировала пробел, чтобы обойти это: thisis \ * one * \ word .

Эти ограничения могут быть сняты в будущих версиях документации.

Также можно заменить или расширить часть этой встроенной разметки с помощью роли.Обратитесь к Роли для получения дополнительной информации.

Списки и блоки, похожие на цитаты

Разметка списка (ссылка) естественная: просто поместите звездочку в начало абзаца и правильный отступ. То же самое касается пронумерованных списки; их также можно автоматизировать с помощью знака # :

 * Это маркированный список.
* Имеет два предмета, второй
  item использует две строки.

1. Это нумерованный список.
2. В нем тоже есть два предмета.

#. Это нумерованный список.
#. В нем тоже есть два предмета.

Вложенные списки возможны, но имейте в виду, что они должны быть отделены от элементы родительского списка пустыми строками:

 * это
* список

  * с вложенным списком
  * и некоторые подпункты

* и здесь родительский список продолжается

Списки определений (ref) создаются следующим образом:

 термин (до строки текста)
   Определение термина, в котором должен быть отступ

   и даже может состоять из нескольких абзацев

следующий семестр
   Описание.

Обратите внимание, что термин не может содержать более одной строки текста.

Цитированные абзацы (ref) создаются простым отступом их больше, чем окружающие абзацы.

Блоки строк (ref) — это способ сохранения разрывов строк:

 | Эти строки
| сломан точно как в
| исходный файл.

Также доступны еще несколько специальных блоков:

  • списков полей (см. С оговорками, указанными в Полевые списки)

  • списки опций (ref)

  • цитируемые буквенные блоки (исх.)

  • doctest блоки (ref)

Буквальные блоки

Буквенные блоки кода (ref) вводятся окончанием параграф со спецификацией

re — Операции с регулярными выражениями — Python 3.Документация 9.1rc1

Исходный код: Lib / re.py

Этот модуль обеспечивает операции сопоставления регулярных выражений, аналогичные те, что есть в Perl.

И шаблоны, и строки для поиска могут быть строками Unicode ( str ) а также 8-битные строки ( байт, ). Однако строки Unicode и 8-битные строки нельзя смешивать: то есть вы не можете сопоставить строку Unicode с байтовым шаблоном или наоборот; аналогично, при запросе замены, замена строка должна иметь тот же тип, что и шаблон, и строка поиска.

Регулярные выражения используют символ обратной косой черты ( '\' ) для обозначения специальные формы или разрешить использование специальных символов без вызова их особое значение. Это противоречит использованию Python того же символ того же назначения в строковых литералах; например, чтобы соответствовать буквальная обратная косая черта, возможно, придется написать '\\\\' в качестве шаблона строка, потому что регулярное выражение должно быть \ , а каждое обратная косая черта должна быть выражена как \ внутри обычной строки Python буквальный.Также обратите внимание, что любые недопустимые escape-последовательности в Python использование обратной косой черты в строковых литералах теперь генерирует DeprecationWarning и в будущем это станет SyntaxError . Это поведение произойдет, даже если это допустимая escape-последовательность для регулярного выражения.

Решение состоит в том, чтобы использовать нотацию строк Python для регулярных выражений. узоры; обратная косая черта не обрабатывается каким-либо особым образом в строковом литерале с префиксом 'r' .Итак, r "\ n" — это двухсимвольная строка, содержащая '\' и 'n' , а "\ n" — это односимвольная строка, содержащая новая линия. Обычно шаблоны выражаются в коде Python с использованием этого необработанного строковое обозначение.

Важно отметить, что большинство операций с регулярными выражениями доступны как функции и методы на уровне модуля на скомпилированные регулярные выражения. Функции — это ярлыки которые не требуют предварительной компиляции объекта регулярного выражения, но пропускают некоторые параметры тонкой настройки.

См. Также

Сторонний модуль регулярных выражений, который имеет API, совместимый с модулем стандартной библиотеки re , но предлагает дополнительные функции и более полную поддержку Unicode.

Синтаксис регулярного выражения

Регулярное выражение (или RE) определяет набор строк, которые ему соответствуют; в функции в этом модуле позволяют проверить, соответствует ли конкретная строка заданному регулярное выражение (или если данное регулярное выражение соответствует определенному строка, что сводится к тому же самому).

Регулярные выражения могут быть объединены в новые регулярные выражения; если A и B являются регулярными выражениями, тогда AB также является регулярным выражением. В общем, если строка p соответствует A , а другая строка q соответствует B , строка pq будет соответствовать AB. Это верно, если A или B не содержат низкий приоритет. операции; граничные условия между A и B ; или иметь пронумерованную группу Ссылки.Таким образом, сложные выражения можно легко построить из более простых примитивные выражения, подобные описанным здесь. Подробности теории и реализации регулярных выражений, обратитесь к книге Фридла [Frie09], или почти любой учебник по построению компиляторов.

Далее следует краткое объяснение формата регулярных выражений. Для

Учебное пособие по созданию грунтовки | Geneious Prime

Упражнение 5: Дизайн пар праймеров для ПЦР

В этом упражнении мы воспользуемся инструментом Primers → Design New Primers… для создания праймеров для ПЦР для амплификации части гена COX1 из генома мамонта.

Щелкните митохондрию NC_007596 — Mammuthus primigenius (шерстистый мамонт), полный геном и найдите ген COX1. Если у вас возникли проблемы с поиском COX1, откройте вкладку Annotations and Tracks справа от средства просмотра последовательности и введите COX1 в поле фильтра.

После выбора аннотации COX1 нажмите кнопку Primers и выберите Design New Primers… .

В этом диалоговом окне вы можете указать, где вы хотите разместить праймеры, какой размер продукта ПЦР вы хотите вернуть, а также такие характеристики, как размер и температура плавления.В разделе Task выберите Generic и установите флажок Included Region . Это указывает, где будут располагаться праймеры, поэтому должно быть установлено значение от 5,331 до 6 878 — пары оснований, которые охватывает ген COX1. Если есть определенная часть гена, которую вы хотите амплифицировать в ПЦР, установите это в Target Region. В этом примере у нас нет конкретной области COX1, которую мы хотим амплифицировать, но мы хотим, чтобы наши продукты ПЦР имели длину менее 300 п.н., чтобы праймеры работали с деградированной ДНК.Поэтому снимите флажок Target Region и установите размер продукта между 200 и 300 bp с оптимальным размером 250 bp . Установите Число пар для создания равным 1.

В разделе «Расчет Tm » приведены подробные сведения о формуле, используемой для расчета точки плавления олигонуклеотидов. Вы можете оставить это значение по умолчанию.

Разверните раздел «Характеристики » . Здесь вы можете установить требуемые свойства праймеров, такие как длина праймера, оптимальная температура плавления (Tm) и штрафы для шпилек и праймеров-димеров.Для многих приложений настройки по умолчанию будут работать нормально, но вам может потребоваться отрегулировать их, если не найдено подходящих праймеров с настройками по умолчанию, например, если у вас есть особенно богатая целевая последовательность GC или AT или необходимость в более длинных праймерах. Для праймеров, которые мы здесь разрабатываем, мы можем использовать значения по умолчанию для большинства этих параметров, за исключением Max Tm Difference . Установите значение 2, чтобы ограничить разницу Tm между праймерами F и R и гарантировать, что они будут работать в одной реакции ПЦР.

Окно «Новые праймеры вашего дизайна» теперь должно выглядеть следующим образом:

Щелкните OK , и Geneious обновит последовательность подходящими праймерами, отображаемыми в виде аннотаций. Выберите аннотацию COX1 и увеличьте ее, используя кнопку масштабирования справа от средства просмотра последовательности. Теперь вы должны увидеть аннотации праймеров, названные по базовому номеру, с которого они начинаются (если вы их не видите, убедитесь, что вы удалили COX1 из поля фильтра на вкладке «Аннотации и треки»).